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crystalzxz

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[求助] MOPAC计算液相中生成热的问题

本人刚刚涉足，会的不多，现根据《化学图文设计与分子模拟计算》书中第四章4.9节的内容进行了计算
书中192页关于甘氨酸在不同相中的生成热的问题：
首先建立甘氨酸的分子模型，再使用MOPAC对该分子进行能量最小化，并计算其生成热，选择的方法也是PM3，其他均为默认选项，在气相中，计算值与书中相近，具体结果如下：
Mopac Job:  PM3 CHARGE=0 EF GNORM=0.01000 SHIFT=80
Finished @ Heat of Formation = -93.87459 Kcal/Mol （书中值-92.75386）
但当我选择液相时，即在solvent中选择COSMO时，其计算结果无论是溶剂可及表面还是生成热都与书中有较大差别，具体如下：
Mopac Job:  PM3 COSMO CHARGE=0 COSMO EF GNORM=0.100 SHIFT=80
Mopac Interface: COSMO Area = 106.21 A^2 （书中值52.36067）
Mopac Interface: COSMO Volume = 88.98 A^3
Mopac Interface: Heat of Formation = -93.87459 Kcal/Mol （书中值-108.32861）
Finished @ RMS Gradient = 0.03569 (< 0.10000) Heat of Formation = -93.87459 Kcal/Mol
而后我有对其他分子进行了计算，发现我所计算的结果中，气态和液态中的生成热大都相差不大。
我所用的为MOPAC2009，chemoffice2010，在选择COSMO时，还会有其他选项，如H2O，CCL4等，但当我选择H2O时，则计算报错，导出报错文件显示不能识别关键词H2O:
UNRECOGNIZED KEY-WORDS: ( H2O)，
IF THESE ARE DEBUG KEYWORDS, ADD THE KEYWORD "DEBUG"
Errors detected in keywords.  Job stopped here to avoid wasting time.
但是如果在关键词中添加DEBUG，则将H2O当做BUG忽略掉，计算结果与气相相同，
想请问下这种情况我想得到液相状态下的生成热和溶液可及表面积该如何处理。
谢谢啦

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1楼 2011-07-13 17:49:37

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crystalzxz

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有没有人遇到同样的问题啊

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2楼2011-07-14 09:49:56

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damihu2011

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198969楼: Originally posted by crystalzxz at 2011-07-13 17:49:37:
本人刚刚涉足，会的不多，现根据《化学图文设计与分子模拟计算》书中第四章4.9节的内容进行了计算
书中192页关于甘氨酸在不同相中的生成热的问题：
首先建立甘氨酸的分子模型，再使用MOPAC对该分子进行能量最小 ...

mopac输入文件格式是什么》？？

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