| 查看: 1397 | 回复: 3 | |||
[求助]
MOPAC计算液相中生成热的问题
|
|
本人刚刚涉足，会的不多，现根据《化学图文设计与分子模拟计算》书中第四章4.9节的内容进行了计算 书中192页关于甘氨酸在不同相中的生成热的问题： 首先建立甘氨酸的分子模型，再使用MOPAC对该分子进行能量最小化，并计算其生成热，选择的方法也是PM3，其他均为默认选项，在气相中，计算值与书中相近，具体结果如下： Mopac Job: PM3 CHARGE=0 EF GNORM=0.01000 SHIFT=80 Finished @ Heat of Formation = -93.87459 Kcal/Mol （书中值-92.75386） 但当我选择液相时，即在solvent中选择COSMO时，其计算结果无论是溶剂可及表面还是生成热都与书中有较大差别，具体如下： Mopac Job: PM3 COSMO CHARGE=0 COSMO EF GNORM=0.100 SHIFT=80 Mopac Interface: COSMO Area = 106.21 A^2 （书中值52.36067） Mopac Interface: COSMO Volume = 88.98 A^3 Mopac Interface: Heat of Formation = -93.87459 Kcal/Mol （书中值-108.32861） Finished @ RMS Gradient = 0.03569 (< 0.10000) Heat of Formation = -93.87459 Kcal/Mol 而后我有对其他分子进行了计算，发现我所计算的结果中，气态和液态中的生成热大都相差不大。 我所用的为MOPAC2009，chemoffice2010，在选择COSMO时，还会有其他选项，如H2O，CCL4等，但当我选择H2O时，则计算报错，导出报错文件显示不能识别关键词H2O: UNRECOGNIZED KEY-WORDS: ( H2O)， IF THESE ARE DEBUG KEYWORDS, ADD THE KEYWORD "DEBUG" Errors detected in keywords. Job stopped here to avoid wasting time. 但是如果在关键词中添加DEBUG，则将H2O当做BUG忽略掉，计算结果与气相相同， 想请问下这种情况我想得到液相状态下的生成热和溶液可及表面积该如何处理。 谢谢啦 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 化学污染与环境健康 |
» 猜你喜欢
Renlab@monash全奖博士机会，最后三天！
已经有0人回复
-
双非本硕光催化方向想读博，请各位老师看看我！
已经有2人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有257人回复
-
今年面上没有消息，想来是没了，散个金攒攒人品，为明年祈福
已经有582人回复
-
合肥工业大学854仪器技术综合专业课考研
已经有0人回复
-
瑞典林雪平大学范立洲课题组现招聘博士后、岗位制博士生
已经有0人回复
-
27年电化学博士毕业，想找海外QS前50的高校读博后求推荐
已经有3人回复
-
中国科大仿生界面材料科学全国重点实验室戴懿涛研究员/江雷院士团队招聘科研助理
已经有0人回复
-
中国科大仿生界面材料科学全国重点实验室戴懿涛研究员/江雷院士团队招聘科研助理
已经有0人回复
-
27年电池/材料类博士申请
已经有1人回复
-
2027年博士申请或转博科研助理 求推荐
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何找氢键及其相关参数？如何生成TEX文件？
已经有7人回复
- 关于量化计算写文章投稿的问题
已经有14人回复
- 哪位虫友可以帮我试个液相条件
已经有13人回复
- abinit计算晶体生成焓的问题讨论
已经有7人回复
- 关于用准简谐方法算热膨胀的问题
已经有6人回复
- 菜鸟问题：细胞保存在液氮罐液相还是气相中？
已经有5人回复
- 高效液相色谱中出峰时间的问题！！！急切
已经有9人回复
- 【求助】关于质量标准研究中液相色谱峰对称性问题
已经有16人回复
- 【求助】药物在液相中的峰面积和检出限均出现问题，该怎么办，大家帮忙分析一下
已经有6人回复
- 【求助】非晶不在保护气体中，在过冷液相区加热会氧化吗？
已经有6人回复
2楼2011-07-14 09:49:56
damihu2011
银虫 (职业作家)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 757.4
- 散金: 1319
- 红花: 15
- 帖子: 3110
- 在线: 344.9小时
- 虫号: 1647341
- 注册: 2012-02-27
- 性别: MM
- 专业: 高分子材料结构与性能
3楼2012-03-27 16:10:47
qianfp
至尊木虫 (正式写手)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 15135.1
- 红花: 3
- 帖子: 685
- 在线: 552.8小时
- 虫号: 215254
- 注册: 2006-03-10
- 性别: GG
- 专业: 分离过程
4楼2012-11-10 08:44:40
100