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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

[求助] 构建全长cDNA中连接的问题

各位朋友:
   我现在要构建全长的cDNA,全长是15186bp,分为12个目的片段。分别连在T载体上了。设计了一系列的酶切连接方案,要连到 PMC18 质粒上,这是一个低拷贝的质粒。现今T载体上和PMC18 上各连了3个目的片段,另外一个PMC18 连接了2个目的片段,可之后的连接之路依旧很艰难。请求朋友们给点好的连接方法,想法。多谢!
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生命即这般无尽变数,辗转来去皆苛求不得
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

帮顶!很活跃的小虫,继续努力哦!

3.1新虫
考虑到对新虫的鼓励和照顾,当前金币小于50,或者注册日期不超过1个月的虫友列为新虫。其他均不在新虫照顾之列。对新虫的处罚从轻,奖励从重。

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2994095
2楼2011-07-09 12:24:23
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-07-09 12:24:23:
帮顶!很活跃的小虫,继续努力哦!

3.1新虫
考虑到对新虫的鼓励和照顾,当前金币小于50,或者注册日期不超过1个月的虫友列为新虫。其他均不在新虫照顾之列。对新虫的处罚从轻,奖励从重。

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我还是新虫啊,我都是铜虫了哇。
生命即这般无尽变数,辗转来去皆苛求不得
3楼2011-07-09 14:21:52
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
青菜小虫(金币+2): 我就是这么做的啊,我现在有3个同步的质粒,顺序就是1234,7896,101112分别连。我的困惑是现在目的片段往每一个质粒上连接都很艰难,连不上了。 2011-07-09 16:08:16
dhd997(金币+2): good 2011-07-09 18:17:38
青菜小虫(金币+1): 谢谢帮助。 2011-07-11 14:15:50
西瓜(金币+2): Good!补上EPI! 2011-07-13 22:52:38
西瓜(EPI+1): 连楼下一起 2011-07-15 17:46:13
把12个片段尽量按顺序分成3-4组同时去连载体,如果酶切位点设计的足够合理的话不按顺序也没什么问题。等这3-4个都验证正确后再互连。
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4楼2011-07-09 15:52:53
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

要我继续解答的话,你得先给我消除这两个疑问。不知道你分段得序号是不是跟序列顺序一致,如果一致的话问题是,1:你的第5个片段哪去了?2:能解释一下你为什么要把第6个片段放到9号片段后面吗?
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5楼2011-07-14 17:13:03
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

引用回帖:
Originally posted by 空谷幽风 at 2011-07-14 17:13:03:
要我继续解答的话,你得先给我消除这两个疑问。不知道你分段得序号是不是跟序列顺序一致,如果一致的话问题是,1:你的第5个片段哪去了?2:能解释一下你为什么要把第6个片段放到9号片段后面吗?

好吧,我只是大体上给你说了一下我的连接方案。因为目的片段都是一段一段连到载体上的啊,我只是给你说了一个顺序而已,89片段连接之后,因为7是反向连到T载体上的,所以连7的时候,7连到89的上方,正好顺序是789,然后我在6片段的上游加了一个酶切位点,把6再连接到T载体上7的上游,这不顺序没变,还是6789的吗?连接方案我都设计好了,所以片段的顺序都不会乱。我唯一感觉困难的就是6在往含T-789载体上连接就很难。这也就是求助的原因,怎么连上去?
生命即这般无尽变数,辗转来去皆苛求不得
6楼2011-07-14 17:30:44
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

可以看出你做分子克隆功底还是很深的,既然6连789连不上去第一直觉就是问题可能出现在片段和载体酶切上,比如你选用的什么酶,酶切是不是彻底之类的
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
7楼2011-07-15 10:56:59
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

很艰巨的任务!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

jiayoubashaonian
8楼2011-08-28 15:30:26
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-28 15:30:26:
很艰巨的任务!

怎么今天把我发的帖子都看了一遍?辛苦你了
生命即这般无尽变数,辗转来去皆苛求不得
9楼2011-08-28 15:56:37
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

西瓜: 小虫开讲要来捧场啊,哈哈哈 2011-08-28 16:51:22
引用回帖:
9楼: Originally posted by 青菜小虫 at 2011-08-28 15:56:37:
怎么今天把我发的帖子都看了一遍?辛苦你了

去分子生物学论坛看了一下,小虫要讲文献了,随后看了一下小虫的帖子,发现能解答一些,索性全部看了一遍!
jiayoubashaonian
10楼2011-08-28 15:58:25
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