| 查看: 1851 | 回复: 7 | ||||
| 本帖产生 2 个 BioEPI ，点击这里进行查看 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
测序结果的疑问
|
||||
|
前面利用CODEHOPE设计了简并引物，克隆一个基因片段。现在测序结果已经出来，令我很疑惑。 割胶回收后连接PMD18载体后，涂平板，挑单菌过夜摇菌，之后提质粒酶切，送去测序。 现在问题来了，同一个平板出来的克隆，测序结果不同，有80%左右的相似性。BLAST后都与相关基因具有比较高的同源性。 现在一共送去了11个克隆测序，目前粗粗看了一下至少有4个不同的片段，之间一般是具有80%左右的同源性。 请问这是怎么回事？基因家族？我要克隆的这个基因是具有基因家族的传统的，拟南芥等植物里一般有4-8个基因家族是很正常的。 还是测序问题？ 令外问一个令我不解的问题，植物的基因组应该是固定的吧，那么那么多基因家族，对应的外显子应该不同，怎么能一一对应基因组DNA呢？ 望大家解惑，谢谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 经验 |
» 猜你喜欢
遇见不省心的家人很难过
已经有16人回复
-
退学或坚持读
已经有25人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有4人回复
-
免疫学博士有名额，速联系
已经有14人回复
-
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有4人回复
-
多组分精馏求助
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教一个关于测序结果的问题
已经有19人回复
- PCR后测序，blast最高匹配度只有32%
已经有3人回复
- 中国高通量测序仪现状调查
已经有10人回复
- 测序结果比对问题
已经有16人回复
- 关于酶切验证克隆的一点点小疑问！
已经有5人回复
- 克隆测序的问题
已经有3人回复
- 测序的问题
已经有24人回复
- 【求助/交流】3'RACE 结果有问题～～～
已经有8人回复
- 【求助/交流】克隆测序问题
已经有6人回复
- 【求助/交流】基因测序结果分析问题
已经有9人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
Postdoctoral Research Fellow Position in Causal Inference Weill CorneIl Medicine
+1/92
-
诚聘 有机光电材料计算方向 博士后、科研助理、访问学生
+1/75
-
深圳大学柔性电子材料方向“申请-考核制”博士生招生
+2/66
-
博后平台选择
+1/63
-
香港科技大学计算物理及流体力学课题组招收全奖博士后及博士生（2026年9月入学）
+1/38
-
南方医科大学生物医学工程学院招收申请考核制博士生2名、博士后2名（2026）
+1/31
-
山东科技大学招聘化学化工博士博士后
+1/28
-
中科院深圳先进院-免疫治疗方向-招收1名博士生(26年9月入学)
+1/13
-
意大利华人老师University of Padova-全额奖学金博士
+1/13
-
四川大学华西医院沈百荣教授课题组科研助理招聘启事
+1/8
-
南方科技大学仉晶晶课题组诚聘有机方向博士后、科研助理
+1/8
-
南方科技大学仉晶晶课题组诚聘有机方向博士后、科研助理
+1/8
-
M200-A摩擦磨损试验机
+1/7
-
上海理工大学顾敏院士、张轶楠教授团队 招聘 2026级 光学工程 博士生
+1/7
-
海南大学化学院—功能分子器件团队2026博士/研究助理招生+博士后招聘
+1/4
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
+1/3
-
上海理工大学“新能源材料”专业-赵斌教授招收申请考核制博士生【能源催化方向】
+1/2
-
电子科技大学 电子科学与工程学院 杨青慧教授 2026年招博士研究生数名
+1/2
-
苏州大学医学院纳米生物医学方向招收申请考核制博士生1名
+1/1
-
澳科大诚招2026年秋季全奖博士研究生（药剂学/生物材料方向）
+1/1
8楼2011-07-06 09:38:20
★ ★ ★ ★
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 前提是PCR没有突变 2011-07-05 12:12:51
shizishanshang(金币+2): 谢谢啊，看着BLAST结果头晕着呢 2011-07-05 17:22:40
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 前提是PCR没有突变 2011-07-05 12:12:51
shizishanshang(金币+2): 谢谢啊，看着BLAST结果头晕着呢 2011-07-05 17:22:40
|
肯定不是测序的问题。对于植物来说最大的可能是因为大的基因家族,也有可能是选择性剪切.不知道你说得相似性是怎么算出来的,是SNP还是有插入或者确实的片段？做过blast没有呢，可以试一下用clustalx或者seqman等比一下看看。 怎么能一一对应基因组DNA呢？这句话没看明白你是什么意思，你是问如何去对应还是已经对应了你不理解为什么？ 你可以通过比对基因组序列和mRNA序列来分析你这些序列所对应的基因组的结构的，这个可以帮助你确定他们是基因家族还是选剪以及是如何剪切的。植物的基因组有多倍体。 另外还有个问题，不知道的模板是DNA还是cDNA. |
2楼2011-07-05 10:39:32
★ ★ ★ ★
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 有一定道理 2011-07-05 12:13:39
shizishanshang(金币+1): 恩，问了一下公司说测序肯定没有问题，我的片段大约850bp，测通的 2011-07-05 17:23:19
shizishanshang(金币+2): 已经证明是基因家族，全长已经得到，既是做荧光定量不好设计引物了 2011-10-04 15:15:03
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 有一定道理 2011-07-05 12:13:39
shizishanshang(金币+1): 恩，问了一下公司说测序肯定没有问题，我的片段大约850bp，测通的 2011-07-05 17:23:19
shizishanshang(金币+2): 已经证明是基因家族，全长已经得到，既是做荧光定量不好设计引物了 2011-10-04 15:15:03
|
测序对结果也是有较大影响的，并非楼上说的肯定不是测序的问题。 一般的测序仪在600以内保证没问题，800左右及以上就不准确了，尤其是技术不过关的企业。 你通过兼并引物扩出来的片段我感觉更多的像是基因家族的多个成员，毕竟他们有着相似度很高的保守区段，当然也不排除其他的可能…… |
3楼2011-07-05 10:45:59
4楼2011-07-05 10:50:48