24小时热门版块排行榜    

查看: 3420  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fly_elephan

银虫 (小有名气)

[求助] vasp如何优化指定的几个原子 已有1人参与

对于相当大的体系,采用NSW 和ISIF参数设置是对体系整体进行优化,如INCAR里设置NSW=60,ISIF=4,这样优化会消耗很多时间,所以请老师指点一下,我只想优化指定的几个原子,这样比较节省时间,请问应该 如何设置?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly_elephan

银虫 (小有名气)

谢谢胡同学,我用的是linux服务器上运行的VASP,要在POSCAR里面设置,但是我不会~
7楼2011-06-19 17:53:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

cavediger

金虫 (正式写手)


gzqdyouxia(金币+1): 谢谢指教 2011-06-17 09:23:38
引用回帖:
Originally posted by fly_elephan at 2011-06-16 17:05:16:
对于相当大的体系,采用NSW 和ISIF参数设置是对体系整体进行优化,如INCAR里设置NSW=60,ISIF=4,这样优化会消耗很多时间,所以请老师指点一下,我只想优化指定的几个原子,这样比较节省时间,请问应该 如何设置?

In POSCAR:
Selective dynamics
Cart...
固定的原子坐标后加F, 优化的加T
我们都老得太快,却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅,蓦然发现,本来就有一条笔直的路,直达山顶....
2楼2011-06-16 17:51:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly_elephan

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cavediger at 2011-06-16 17:51:43:
In POSCAR:
Selective dynamics
Cart...
固定的原子坐标后加F, 优化的加T

老师,好像不行啊,POSCAR加上Selective dynamics这一行以后运行就提示没有坐标输入,然后就结束运行了,去掉就又可以正常运行了。
4楼2011-06-16 21:45:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cavediger

金虫 (正式写手)

★ ★
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢指教 2011-06-17 09:23:52
引用回帖:
Originally posted by fly_elephan at 2011-06-16 21:45:57:
老师,好像不行啊,POSCAR加上Selective dynamics这一行以后运行就提示没有坐标输入,然后就结束运行了,去掉就又可以正常运行了。

不好意思,Selecvtive....下一行应为Direct,注意大小写,如下格式:
sys=xxx(111)-3xsqrt(3)                     
   3.95230000000000     
     2.1213203435596402    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    1.2247448713915889    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    5.7735026918962600
   2   2  24
Selective dynamics
Direct
  0.4054863665508025  0.6038497615780062  0.5127573867832839   T   T   T
  0.5920617558781025  0.6036152904937659  0.5130947435711497   T   T   T
  0.1686988009729342  0.8302014593701986  0.4509938979987685   T   T   T
  0.4989110886373112  0.4865867104595148  0.5065596318505045   T   T   T
  0.9917961686555932  0.0028529482852356  0.4031462662986223   F   F   F
  0.3401384914028052 -0.0000687349729184  0.4003163461852405   F   F   F
  0.6682089317001769 -0.0020904650034856  0.3990166341928203   F   F   F
  0.1659233469473287  0.4881067613003330  0.4002903623880371   F   F   F
  0.5041593041669211  0.4949235970280504  0.4011317407648622   F   F   F
  0.8316290404870048  0.4987159636326962  0.3993741797352651   F   F   F
  0.1666666666666643  0.1666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.5000000000000000  0.1666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.8333333333333357  0.1666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.0000000000000000  0.6666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.3333333333333357  0.6666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.6666666666666643  0.6666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.3333333333333357  0.3333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.0000000000000000  0.3333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1666666666666643  0.8333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.5000000000000000  0.8333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.8333333333333357  0.8333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1666666666666643  0.5000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.8333333333333357  0.5000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
我们都老得太快,却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅,蓦然发现,本来就有一条笔直的路,直达山顶....
5楼2011-06-17 06:29:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程274求调剂 +4 Lilithan 2026-03-01 4/200 2026-03-02 12:06 by yuchj
[考研] 268求调剂 +4 简单点0 2026-03-02 5/250 2026-03-02 11:54 by ms629
[考研] 材料学硕318求调剂 +14 February_Feb 2026-03-01 16/800 2026-03-02 11:17 by yuchj
[基金申请] 此成果不能导入原因:元数据必填信息不完整,可 进行补充。 +4 Kittylucky 2026-03-02 5/250 2026-03-02 11:07 by jurkat.1640
[考研] 材料工程专硕283求调剂 5+4 ,!? 2026-03-02 6/300 2026-03-02 11:07 by 黑!在干嘛
[考研] 284求调剂 +10 天下熯 2026-02-28 11/550 2026-03-02 11:03 by 无际的草原
[考研] 0856材料调剂 +4 沿岸有贝壳OUC 2026-03-02 4/200 2026-03-02 10:19 by 公瑾逍遥
[考研] 282求调剂 +3 2103240126 2026-03-02 4/200 2026-03-02 09:25 by 汪!?!
[考研] 0857调剂 +4 一ll半 2026-02-28 5/250 2026-03-02 02:33 by 908055542
[考研] 275求调剂 +3 明远求学 2026-03-01 3/150 2026-03-01 22:29 by 刘兵
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博!
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
[考研] 311求调剂 +9 南迦720 2026-02-28 10/500 2026-03-01 10:55 by sunny81
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
信息提示
请填处理意见