24小时热门版块排行榜    

查看: 3893  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fly_elephan

银虫 (小有名气)

[求助] vasp如何优化指定的几个原子 已有1人参与

对于相当大的体系,采用NSW 和ISIF参数设置是对体系整体进行优化,如INCAR里设置NSW=60,ISIF=4,这样优化会消耗很多时间,所以请老师指点一下,我只想优化指定的几个原子,这样比较节省时间,请问应该 如何设置?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cavediger

金虫 (正式写手)

★ ★
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢指教 2011-06-17 09:23:52
引用回帖:
Originally posted by fly_elephan at 2011-06-16 21:45:57:
老师,好像不行啊,POSCAR加上Selective dynamics这一行以后运行就提示没有坐标输入,然后就结束运行了,去掉就又可以正常运行了。

不好意思,Selecvtive....下一行应为Direct,注意大小写,如下格式:
sys=xxx(111)-3xsqrt(3)                     
   3.95230000000000     
     2.1213203435596402    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    1.2247448713915889    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    5.7735026918962600
   2   2  24
Selective dynamics
Direct
  0.4054863665508025  0.6038497615780062  0.5127573867832839   T   T   T
  0.5920617558781025  0.6036152904937659  0.5130947435711497   T   T   T
  0.1686988009729342  0.8302014593701986  0.4509938979987685   T   T   T
  0.4989110886373112  0.4865867104595148  0.5065596318505045   T   T   T
  0.9917961686555932  0.0028529482852356  0.4031462662986223   F   F   F
  0.3401384914028052 -0.0000687349729184  0.4003163461852405   F   F   F
  0.6682089317001769 -0.0020904650034856  0.3990166341928203   F   F   F
  0.1659233469473287  0.4881067613003330  0.4002903623880371   F   F   F
  0.5041593041669211  0.4949235970280504  0.4011317407648622   F   F   F
  0.8316290404870048  0.4987159636326962  0.3993741797352651   F   F   F
  0.1666666666666643  0.1666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.5000000000000000  0.1666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.8333333333333357  0.1666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.0000000000000000  0.6666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.3333333333333357  0.6666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.6666666666666643  0.6666666666666643  0.2999999999999972   F   F   F
  0.3333333333333357  0.3333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.0000000000000000  0.3333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1666666666666643  0.8333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.5000000000000000  0.8333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.8333333333333357  0.8333333333333357  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1666666666666643  0.5000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.8333333333333357  0.5000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
我们都老得太快,却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅,蓦然发现,本来就有一条笔直的路,直达山顶....
5楼2011-06-17 06:29:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

cavediger

金虫 (正式写手)


gzqdyouxia(金币+1): 谢谢指教 2011-06-17 09:23:38
引用回帖:
Originally posted by fly_elephan at 2011-06-16 17:05:16:
对于相当大的体系,采用NSW 和ISIF参数设置是对体系整体进行优化,如INCAR里设置NSW=60,ISIF=4,这样优化会消耗很多时间,所以请老师指点一下,我只想优化指定的几个原子,这样比较节省时间,请问应该 如何设置?

In POSCAR:
Selective dynamics
Cart...
固定的原子坐标后加F, 优化的加T
我们都老得太快,却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅,蓦然发现,本来就有一条笔直的路,直达山顶....
2楼2011-06-16 17:51:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly_elephan

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cavediger at 2011-06-16 17:51:43:
In POSCAR:
Selective dynamics
Cart...
固定的原子坐标后加F, 优化的加T

老师,好像不行啊,POSCAR加上Selective dynamics这一行以后运行就提示没有坐标输入,然后就结束运行了,去掉就又可以正常运行了。
4楼2011-06-16 21:45:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胡同学

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-06-19 20:05:19
引用回帖:
Originally posted by fly_elephan at 2011-06-16 17:05:16:
对于相当大的体系,采用NSW 和ISIF参数设置是对体系整体进行优化,如INCAR里设置NSW=60,ISIF=4,这样优化会消耗很多时间,所以请老师指点一下,我只想优化指定的几个原子,这样比较节省时间,请问应该 如何设置?

你是用的MedeA的平台吗?那个平台直接用鼠标选,想选那个原子就选哪个,很方便,跟复制粘贴那样简单
人生苦短,抓紧科研,抓紧找对象。
6楼2011-06-19 13:04:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 4/200 2026-08-23 20:46 by 0p9y1isJp2jM
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 19:31 by lXgU0RvNTDC9
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 19:22 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 8/400 2026-08-23 18:58 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 18:46 by lXgU0RvNTDC9
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 5/250 2026-08-23 12:09 by LR9qGULyN2ew
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 10/500 2026-08-23 07:17 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 炎黄贵胄 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见