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da_da

金虫 (小有名气)

[求助] 两个基因融合不起来

现在在做基因的融合表达,把A和B两个基因用overlapPCR的方法融合起来。A B两个基因都用PCR的方法扩出来了,大小与预期的大小一致,并且都是用的保真酶。但overlapPCR就是做不好,两个基因怎么也融合不到一起,都做了好几遍了,我用的是PFU酶,2kb/min,融合基因大概2500bp,是不是酶的问题啊,扩增速度太慢了?
还有就是我的A基因是直接从基因组中扩增的,B基因是从构建好的PQE载体中扩增的。是不是必须要从构建好的载体中扩增啊?哪位高手指点下啊
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da_da

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-12 17:45:06:
基因从哪里扩增出来的没关系的。
Overlaping PCR的产物一般很少的,条带很淡,你的图最好上来看看。我做的一般上10ul的样,能看到淡淡的条带就ok,有杂带也ok,因为我们还会再拿这个产物作为模板再进行一次扩增。 ...

我上的是5UL 再试试吧
心有多大,江湖就有多大!
5楼2011-06-12 20:45:41
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
da_da(金币+2): 2011-06-13 18:35:28
da_da(金币+1): 2011-06-15 10:06:41
dhd997(金币+5): good 2011-07-04 18:04:43
基因从哪里扩增出来的没关系的。
Overlaping PCR的产物一般很少的,条带很淡,你的图最好上来看看。我做的一般上10ul的样,能看到淡淡的条带就ok,有杂带也ok,因为我们还会再拿这个产物作为模板再进行一次扩增。
我印象中Pfu酶的扩增速度比Taq会慢很多,Taq一般是1kb/min,Pfu是600bp/min左右,楼主用的哪家的Pfu酶?2kb/min很快啊。
2楼2011-06-12 17:45:06
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


dhd997(金币+1): 2011-07-04 18:04:50
Pfu酶达不到2kb/min的!
3楼2011-06-12 20:04:47
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da_da

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lxj341401 at 2011-06-12 20:04:47:
Pfu酶达不到2kb/min的!

说明书上是这样写的,如果达不到也太害人了
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4楼2011-06-12 20:43:16
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