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系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
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moucheng
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[
求助
]
系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
如图,请问HJ-5与AB021198的同源性是怎么看出来的啊!我怎么感觉HJ-5与AJ276351的亲缘性更高啊??请高人指点!谢谢!
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2011-05-23 10:57:44
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虫号: 1046859
注册: 2010-06-24
性别: GG
专业: 环境微生物学
同源性,用数值表示一般是指序列相似性,你从系统树上面是看不出来的,而且你的系统树的HJ-5那里的支持率很低,才23 上面才26,都是不可信的,不能说谁与谁更近……
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5楼
2011-05-31 10:46:47
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金虫
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专业: 环境微生物学
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amisking(金币+1): 鼓励应助 2011-05-23 20:16:19
moucheng(金币+1): 能否举个列子啊? 2011-05-24 10:11:47
呃,同源性是比对出来的吧。进化树上的远近要用尺子量的。
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2楼
2011-05-23 14:45:37
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billowzeng
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专业: 环境微生物学
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amisking(金币+1): 鼓励应助 2011-05-23 20:16:29
moucheng(金币+1): 能否举个列子啊? 2011-05-24 10:12:00
是通过Blast比对确定的吧“测序结果在Blast中进行同源性检索”
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3楼
2011-05-23 16:32:31
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hnzhaolongfei
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专业: 环境微生物学
★ ★
silicare(金币+2): 鼓励发帖交流,欢迎常来生物综合版 2011-05-27 12:12:45
建议用DNAMAN对序列进行亲缘关系计算。HJ-5与AB021198的同源性,和与AJ276351的同源性一下就出来了。
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天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物
4楼
2011-05-27 06:36:24
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