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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
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moucheng

金虫 (正式写手)

[求助] 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助

如图，请问HJ-5与AB021198的同源性是怎么看出来的啊！我怎么感觉HJ-5与AJ276351的亲缘性更高啊？？请高人指点！谢谢！
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人活在世界上不容易，凡事多看开些，开开心心，快快乐乐，健康长寿
1楼 2011-05-23 10:57:44
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小心点

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
amisking(金币+1): 鼓励应助 2011-05-23 20:16:19
moucheng(金币+1): 能否举个列子啊? 2011-05-24 10:11:47
呃，同源性是比对出来的吧。进化树上的远近要用尺子量的。
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2楼2011-05-23 14:45:37
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billowzeng

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
amisking(金币+1): 鼓励应助 2011-05-23 20:16:29
moucheng(金币+1): 能否举个列子啊? 2011-05-24 10:12:00
是通过Blast比对确定的吧“测序结果在Blast中进行同源性检索”
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3楼2011-05-23 16:32:31
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hnzhaolongfei

木虫 (著名写手)

将军
★ ★
silicare(金币+2): 鼓励发帖交流，欢迎常来生物综合版 2011-05-27 12:12:45
建议用DNAMAN对序列进行亲缘关系计算。HJ-5与AB021198的同源性，和与AJ276351的同源性一下就出来了。
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天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物
4楼2011-05-27 06:36:24
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
同源性，用数值表示一般是指序列相似性，你从系统树上面是看不出来的，而且你的系统树的HJ-5那里的支持率很低，才23 上面才26,都是不可信的，不能说谁与谁更近……
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5楼2011-05-31 10:46:47
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2011-05-31 10:46:47:
同源性，用数值表示一般是指序列相似性，你从系统树上面是看不出来的，而且你的系统树的HJ-5那里的支持率很低，才23 上面才26,都是不可信的，不能说谁与谁更近……

对头
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钱要流动，人要走动
6楼2011-05-31 16:12:28
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416114799

至尊木虫 (知名作家)
作者文字表述说的同源性是NCBI里面Blast出来的，即那个max indent，而进化树出来的那个数字是表示相近的二者同源性的可靠程度，一般要＞66才认为可信，判断同种需要95才行。这个进化树本身有问题。但是你的理解也错误了。作者的同源关系的结论是从网络的数据库比对来的，但是这个进化树做得太差了，所以误导了你。。
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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
7楼2012-06-14 10:41:45
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一桶稀泥

木虫 (正式写手)
并不是用构建的这个树得出来的这个结论，是前面说用blast的结果。
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我是小女孩，让着我点！！！
8楼2020-02-07 21:35:14
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