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yf8541255

铁虫 (初入文坛)

[交流] 微卫星SSR引物设计 已有9人参与

我在做一种植物的微卫星引物开发,现在已经对单克隆测序拿到了序列,利用SSR Hunter 也已经找到了SSR序列,现在想用primer primer5.0设计引物。
我是这方面的初学者,不太了解这个软件,想知道在设计引物的时候如何知道SSR片段两端的保守序列呢?
以下是我通过SSR Hunter 获得的其中一个SSR序列,有没有行家给讲解一下

TC  重复次数: 10    起始位置: 17701
17551tcatagaaatgggcggttggatcctccccttcaaatctccttctctctgcgtccaagactaatccaaaaaatcaggaatctagggtttgcttctcgctaatggccgacttcaactccttcgccccactgcagtaaagccagtgcggctgaTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCgatctctcgagctggaagcaatggcggccgacgtatcggtgagttctgaggcggtcaagccgtgctgtgcgaaggtatgaatttctgggctttgtttgaattcttgtttcgagtttgttcaattggtgttcgatctcgaggttgggctga 17870
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路人甲
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Nancybicy

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
在重复序列的两端各150bp就认为是保守序列,直接在里面设计引物就好了
5楼2012-02-22 14:01:17
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liugs

禁虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

2楼2011-05-18 08:15:05
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niuzheng

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
很头痛哦,要是不行再叫公司做对引物,还不行再做对引物。多麻烦啊。
要一步一步的向前走啊。
3楼2011-10-23 16:28:16
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wxq999

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
西瓜:编辑内容 2011-10-24 17:26
西瓜(金币-10): 2011-10-24 17:27:11
-------------广告内容--------------------

[ Last edited by 西瓜 on 2011-10-24 at 17:26 ]
4楼2011-10-24 17:05:52
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