| 查看: 643 | 回复: 3 | ||
[求助]
siesta运行出错！！！
|
|
siesta运行时出现如下错误，望高手解答！ * ProcessorY, Blocksize: 1 24 k-point displ. along 3 input, could be: 0.00 0.50 Kpoints in: 2 . Kpoints trimmed: 2 siesta: k-point coordinates (Bohr**-1) and weights: siesta: 1 0.000000 0.000000 0.000000 0.500000 siesta: 2 0.000000 0.000000 0.156111 0.500000 siesta: k-grid: Number of k-points = 2 siesta: k-grid: Cutoff (effective) = 10.649 Ang siesta: k-grid: Supercell and displacements siesta: k-grid: 1 0 0 0.000 siesta: k-grid: 0 1 0 0.000 siesta: k-grid: 0 0 2 0.000 ABORT(FOX) Tried to add text section in wrong place: 1 abort: |
回复此楼» 猜你喜欢
中国科学院深圳先进技术研究院-光纤传感课题组招生-中国科学院大学、深圳理工大学联培
已经有4人回复
-
调剂推荐
已经有4人回复
-
总分322求生物学/生化与分子/生物信息学相关调剂
已经有5人回复
-
0703化学338求调剂！
已经有3人回复
-
284求调剂
已经有7人回复
-
271求调剂
已经有6人回复
-
312求调剂
已经有9人回复
-
352求调剂
已经有4人回复
-
085602化学工程求调剂。
已经有3人回复
-
085600材料与化工306
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Dalton2011编译问题请教专家
已经有10人回复
- 关于k点间距的问题
已经有3人回复
- siesta运行出现问题，Error in Cholesky factorisation in cdiag，原子间距过小，求助
已经有5人回复
- 实在不知道siesta如何开始运行，折腾了好几天 能尝试的都试了。
已经有6人回复
- 请大家帮忙看看siesta输入文件有哪些错误
已经有8人回复
- vasp 集群并行出错
已经有7人回复
- 提交siesta任务计算失败
已经有11人回复
- ifort（mpiifort）并行编译siesta
已经有9人回复
- 运行已经编译好的资源：vasp52opt.rar 出现并行不能用的问题！
已经有3人回复
- cp2k并行编译出错
已经有3人回复
- siesta运行，forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
已经有7人回复
- 原来编译的siesta突然不能用，重新编译没错，运行出错
已经有13人回复
- 请教，为什么siesta编译中没报错，然而运行的时候跑不起来呢
已经有9人回复
- 还是SIESTA安装的问题
已经有9人回复
- 【求助】siesta进行ordern计算出错求助
已经有4人回复
- 【求助】安装siesta2.0.2时如何编译arch.make？？
已经有17人回复
- 【求助】siesta 安装出错
已经有18人回复
- 【求助】Siesta 求siesta软件和安装步骤
已经有8人回复
- 【求助】BSSE of O2运行出错
已经有17人回复
- 【求助】编译siesta
已经有12人回复
- 【求助】siesta输入文件中赝势文件的作用？
已经有8人回复
- 【求助】siesta运行需要.psf文件吗
已经有4人回复
- 【求助】linux下lapack库编译测试错误
已经有3人回复
- 【求助】siesta3.0 安装，错误一箩筐
已经有11人回复
zhangguangping
木虫 (著名写手)
- 1ST强帖: 23
- 应助: 71 (初中生)
- 贵宾: 0.031
- 金币: 1973.1
- 散金: 9059
- 红花: 79
- 帖子: 2681
- 在线: 2128.8小时
- 虫号: 529624
- 注册: 2008-03-20
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
2楼2011-05-16 02:41:06
|
输入文件如下 此外说明一下，原来是可以计算的，后来重新编译了一下就出现上述错误 # t SystemName d SystemLabel d NumberOfAtoms 96 NumberOfSpecies 2 %block ChemicalSpeciesLabel 1 8 O 2 22 Ti %endblock ChemicalSpeciesLabel PAO.EnergyShift 100 meV PAO.BasisType split PAO.BasisSize DZP LatticeConstant 1.0 Ang # Lattice constant alat %block LatticeVectors # Lattice vectors, in units of alat 25.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 25.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 10.649200000000000 %endblock LatticeVectors #kgrid_cutoff 20. Ang %block kgrid_Monkhorst_Pack 1 0 0 0.0 0 1 0 0.0 0 0 2 0.0 %endblock kgrid_Monkhorst_Pack # SPIN options xc.functional GGA # Exchange-correlation functional xc.authors PBE # Exchange-correlation version SpinPolarized F # Logical parameters are: yes or no FixSpin F TotalSpin 0.0 NonCollinearSpin F # 'T', 'F' MeshCutoff 200. Ry # Equivalent plane wave cutoff for the grid LongOutput true # SCF options DM.Tolerance 1.d-4 # Tolerance in maximum difference between input and output DM MaxSCFIterations 300 # Maximum number of SCF iter DM.UseSaveDM T # to use continuation files DM.MixingWeight 0.25 # New DM amount for next SCF cycle DM.NumberPulay 5 DM.MixSCF1 F DM.PulayOnFile F # Store in memory ('F') or in files ('T') # NeglNonOverlapInt T # 'F'=do not neglect SolutionMethod Diagon # OrderN or Diagon ElectronicTemperature 300 K # Temp. for Fermi smearing # MD options MD.TypeOfRun CG # Type of dynamics: MD.VariableCell T MD.NumCGsteps 300 # Number of CG steps for coordinate optimization ZM.UnitsLength Ang #the units of length used during Z-matrix input ZM.UnitsAngle deg #the units of angles used during Z-matrix input ZM.ForceTolLength 0.02 eV/Ang #controls the convergence with respect to forces on Z-matrix lengths ZM.ForceTolAngle 0.00356549 Ry/rad #controls the convergence with respect to forces on Z-matrix angles ZM.MaxDisplLength 0.1 Ang # controls the maximum change in a Zmatrix length during an optimisation step ZM.MaxDisplAngle 0.003 rad # controls the maximum change in a Z-matrix angle during an optimisation step ZM.CalcAllForces T # Default value AtomicCoordinatesFormat Ang # Format for inates %block Zmatrix cartesian %endblock Zmatrix #WriteWaveFunctions T # coefficients of the wavefunctions in the basis set orbitals expansion #WaveFuncKPointsScale ReciprocalLatticeVectors #%block WaveFuncKPoints #0.000 0.000 0.000 from 1 to 14 # Gamma wavefuncs 1 to 10 #%endblock WaveFuncKPoints # Output options WriteCoorInitial T WriteCoorStep T WriteCoorXmol T WriteForces T WriteEigenvalues F # If .false., it writes them in the file Systemlabel.EIG WriteMullikenPop 1 # Write Mulliken Population Analysis #WriteKpoints T #WriteKbands T #WriteBands T WriteMDCoorXmol T WriteMDhistory T # Options for saving or reading information MD.UseSaveZM T # Use stored positions and velocities MD.UseSaveCG T # Use stored positions and velocities SaveRho T # Write valence pseudocharge at the mesh SaveDeltaRho T # Write RHOscf-RHOatm at the mesh SaveElectrostaticPotential T # Write the total elect. pot. at the mesh # (local pseudopotential + Hartree) SaveTotalPotential T # write the valence total effective local potential # (local pseudopotential + Hartree + Vxc) WriteSiestaDim T # Write minimum dim to siesta.h and stop WriteDenchar T # Write information for DENCHAR |
3楼2011-05-16 09:21:40
zhangguangping
木虫 (著名写手)
- 1ST强帖: 23
- 应助: 71 (初中生)
- 贵宾: 0.031
- 金币: 1973.1
- 散金: 9059
- 红花: 79
- 帖子: 2681
- 在线: 2128.8小时
- 虫号: 529624
- 注册: 2008-03-20
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
【答案】应助回帖
★ ★
kuku6666(金币+3): 是的，对每一个任务都这样！我该了一下系统时间，就出现这个问题了，是不是跟着个也有关啊，还是都重新编译一下，从最开始？ 2011-05-16 10:39:30
kuku6666(金币+5): 兄弟，谢谢！哈哈 2011-05-16 10:45:33
zzy870720z(金币+2): 谢谢zhang兄指教 2011-05-16 10:54:59
kuku6666(金币+3): 是的，对每一个任务都这样！我该了一下系统时间，就出现这个问题了，是不是跟着个也有关啊，还是都重新编译一下，从最开始？ 2011-05-16 10:39:30
kuku6666(金币+5): 兄弟，谢谢！哈哈 2011-05-16 10:45:33
zzy870720z(金币+2): 谢谢zhang兄指教 2011-05-16 10:54:59
|
那就用原来的版本算。另外你现在的版本对每一个任务都出错还是只对你这一个任务出错。如果对每一个任务出错，说明你的这个编译版本有问题。如果是后者，那么对照一下两个输入文件之间的差别。 |
4楼2011-05-16 10:30:37
