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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS分子动力学那个模块能处理断键和成键啊？
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andong1988

金虫 (小有名气)

[求助] MS分子动力学那个模块能处理断键和成键啊？

小虫子做无定形碳的模拟，按照文献上的说法用熔融淬火法，但是用ms的discover在6500K跑了以后发现金刚石晶体的键一个也没有断掉。按理说金刚石的熔点是3825K，在6500K应该能熔融啊。

后来听说discover不能处理断键和成键。

所以小弟在这里问一下，MS的哪个模块能处理啊？

如能解惑，感激涕零！！
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哈哈哈哈
1楼 2011-04-24 14:44:28
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御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by andong1988 at 2011-04-24 14:44:28:
小虫子做无定形碳的模拟，按照文献上的说法用熔融淬火法，但是用ms的discover在6500K跑了以后发现金刚石晶体的键一个也没有断掉。按理说金刚石的熔点是3825K，在6500K应该能熔融啊。

后来听说discover不能处理 ...

近期我版在做活动，去本主题提问，会有很多牛牛会详细回答你，谢谢。
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莫问前尘事，只怜今世缘，承临纵横风，御剑凡尘路，蹉跎浮华，嬉笑洒脱。
2楼2011-04-25 09:30:32
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andong1988

金虫 (小有名气)
[求助] MS分子动力学那个模块能处理断键和成键啊？

小虫子做无定形碳的模拟，按照文献上的说法用熔融淬火法，但是用ms的discover在6500K跑了以后发现金刚石晶体的键一个也没有断掉。按理说金刚石的熔点是3825K，在6500K应该能熔融啊。

后来听说discover不能处理断键和成键。

所以小弟在这里问一下，MS的哪个模块能处理啊？

如能解惑，感激涕零！！

还有哦就是，如果MS不能做，那还有什么软件能替代呢？
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哈哈哈哈
3楼2011-04-25 14:24:49
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zczc6

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
andong1988(金币+5): 非常感谢，呵呵 2011-05-04 10:05:53
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-05-04 10:50:58
分子动力学基本不管电子的问题，是不能成键断键的，键的形成与断裂需用量子模块，因为涉及电子的问题。
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4楼2011-05-03 22:09:56
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nihao000

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-05-04 10:51:10
CPMD可以，但是在Linux系统下。开源软件
软件名就叫CPMD，方法也是cpmd，你看的一些文献大部分淬火用的就是CPMD

castep与dmol3中的MD都是BOMD，不能淬火。
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5楼2011-05-03 23:11:56
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andong1988

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by nihao000 at 2011-05-03 23:11:56:
CPMD可以，但是在Linux系统下。开源软件
软件名就叫CPMD，方法也是cpmd，你看的一些文献大部分淬火用的就是CPMD

castep与dmol3中的MD都是BOMD，不能淬火。

我想给你们两个人都加金币，怎么加不了啊？呵呵。那就送你朵红花吧。希望不要介意哈。
cpmd我已经在个人电脑上装好了，先练习着。看你发的帖子也多是关于无定形碳的，你也是做这个方向的吗？
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哈哈哈哈
6楼2011-05-04 10:36:32
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nihao000

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by andong1988 at 2011-05-04 10:36:32:
我想给你们两个人都加金币，怎么加不了啊？呵呵。那就送你朵红花吧。希望不要介意哈。
cpmd我已经在个人电脑上装好了，先练习着。看你发的帖子也多是关于无定形碳的，你也是做这个方向的吗？

你怎么编译成功的？

我在自己电脑上装好了，联网。
但是在实验室有台8核的单机电脑，编译不成功。

我还是主要实验方向的。但是老板让涉及模拟，我就实施。太麻烦鸟
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7楼2011-05-04 14:33:51
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andong1988

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by nihao000 at 2011-05-04 14:33:51:
你怎么编译成功的？

我在自己电脑上装好了，联网。
但是在实验室有台8核的单机电脑，编译不成功。

我还是主要实验方向的。但是老板让涉及模拟，我就实施。太麻烦鸟

我也只是在自己电脑上装好的，还没有在工作站上实验呢.确实很麻烦啊！
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哈哈哈哈
8楼2011-05-04 19:30:19
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芊芊草^-^

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by andong1988 at 2011-04-25 14:24:49
MS分子动力学那个模块能处理断键和成键啊？

小虫子做无定形碳的模拟，按照文献上的说法用熔融淬火法，但是用ms的discover在6500K跑了以后发现金刚石晶体的键一个也没有断掉。按理说金刚石的熔点是3825K，在650 ...

请问最后您是怎么实施成功的呢
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认真的做好每一件事
9楼2015-05-24 10:17:20
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yuerku

新虫 (小有名气)
要用到cpmd吗，看起来好麻烦……ms为什么不能搞定
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10楼2016-11-01 11:08:27
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