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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 不应有的键怎么去除？
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灯泡3204

木虫 (著名写手)

[求助] 不应有的键怎么去除？

如图所示，C19不应与H6成键，怎么去除呢？我限制健长：DFIX 0.98 0.01 C19H6，也不管用啊，请求帮助！

pic..JPG
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灯泡3204

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1楼 2013-05-08 09:28:44
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 灯泡3204 at 2013-05-08 18:52:25
重新加了，但还是不对，我也不知道问题出在哪里，奇怪的是前天我检查cif没出现问题，申请到了CCDC号，后来再一检查就出错了，麻烦您帮我看看，谢谢了！...

我用理论加氢给你加上了。不知道行不行，你看看吧。
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  • 附件 1 : YWH130502_JL_B-1-精修B.rar
    • 2013-05-09 09:21:18, 2.01 M

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灯泡3204
学无止境
9楼2013-05-09 09:21:49
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普通回帖

jacques7178

木虫 (正式写手)

至尊旗舰版淫虫

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
lijunjie84: 金币+1, 感谢分享答案！ 2013-05-08 09:57:08
点击确定后，删除即可，delete！O(∩_∩)O~\(^o^)/~
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日月若有双鱼戏，而今苦乐谁与倚-痴茶
2楼2013-05-08 09:41:29
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般选择后，用DELBOND命令。
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3楼2013-05-08 10:14:47
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灯泡3204

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yytsnake at 2013-05-08 10:14:47
一般选择后，用DELBOND命令。

检查CiF后又出现AB类错误：
--------------------------------------------------------------------------------Alert level A
PLAT770_ALERT_2_A Suspect C-H Bond in CIF:   C19    --  H6      ..       1.47 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT035_ALERT_1_B No _chemical_absolute_configuration info given .          ?
PLAT222_ALERT_3_B Large Non-Solvent    H    Uiso(max)/Uiso(min) ..        7.8 Ratio
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H6     ..  H6      ..       1.97 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------
怎么办呢？
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4楼2013-05-08 10:42:44
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灯泡3204

木虫 (著名写手)
难道是O上的H确定有问题？我是ENVI O6，找的H
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5楼2013-05-08 10:44:48
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
灯泡3204: 金币+5, 谢谢，我还是没搞对，奇怪的是昨晚我检查cif没出现问题，申请到了CCDC号，今天再一检查就出错了，麻烦您帮我找一下H，谢谢！ 2013-05-08 17:11:40
就是O上的H的问题。
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6楼2013-05-08 14:31:40
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
灯泡3204: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢，我再多试几回！ 2013-05-09 05:56:55
O6的氢加的有问题。建议删了重新加。
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灯泡3204
学无止境
7楼2013-05-08 21:52:16
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灯泡3204

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-05-08 21:52:16
O6的氢加的有问题。建议删了重新加。

重新加了，但还是不对，我也不知道问题出在哪里，奇怪的是前天我检查cif没出现问题，申请到了CCDC号，后来再一检查就出错了，麻烦您帮我看看，谢谢了！
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  • 附件 1 : 20130507.rar
    • 2013-05-09 07:52:19, 2.01 M
8楼2013-05-09 07:52:25
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 灯泡3204 at 2013-05-09 07:52:25
重新加了，但还是不对，我也不知道问题出在哪里，奇怪的是前天我检查cif没出现问题，申请到了CCDC号，后来再一检查就出错了，麻烦您帮我看看，谢谢了！...

晶体解析加H一般是用理论方法，但是当涉及到H键时要考虑的因素相对较多，是个很花费心思的力气活，不只是只考虑一个H，与之相关的也要考虑，这里除了要调整O---H外，还要调整相邻的甲醇上的H。这是要费一番心思的。试试这个INS文件吧，应该只有C类了。
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    • 2013-05-09 09:49:34, 7.73 K

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灯泡3204
10楼2013-05-09 09:47:29
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