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【求助/交流】大家来看下我的RNA电泳图
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tutufei
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【求助/交流】大家来看下我的RNA电泳图
我想做反转录,然后扩增目的条带,不知道RNA提得可以吗?第一个泳道不知道为什么跟其他的不一样?
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2011-04-17 22:32:22
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zhaohq1209
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rainwander(金币+1, EPI+1): 相应管理员号召,开始加大EPI给予力度~ 2011-04-18 13:22:07
提取的大肠杆菌total RNA,可以用来做转录组分析的。大条带应该是小条带亮度的两倍最好,最差也得亮度差不多,对应的数量差不多。
祝lz实验顺利!
[
Last edited by zhaohq1209 on 2011-4-18 at 09:31
]
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2011-04-18 09:30:10
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wolfebst(金币+1): 鼓励多多交流 2011-04-18 08:11:57
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Originally posted by
tutufei
at 2011-04-17 22:32:22:
我想做反转录,然后扩增目的条带,不知道RNA提得可以吗?第一个泳道不知道为什么跟其他的不一样?
不知lz提取的是什么东东的RNA?
我提过细菌的total RNA。从lz的电泳图来看,质量不好。RIN值太低,表明降解严重。
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2011-04-18 06:48:11
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zhaohq1209
at 2011-04-18 06:48:11:
不知lz提取的是什么东东的RNA?
我提过细菌的total RNA。从lz的电泳图来看,质量不好。RIN值太低,表明降解严重。
提的就是细菌的total RNA,没办法,实验室没做过RNA,所以条件不好,这个电泳没加变性剂
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2011-04-18 13:17:02
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wolfebst(EPI+1): 回答不错 2011-04-18 14:36:44
tutufei(金币+5): 谢谢你的建议! 2011-04-23 00:04:47
引用回帖:
Originally posted by
tutufei
at 2011-04-18 13:17:02:
提的就是细菌的total RNA,没办法,实验室没做过RNA,所以条件不好,这个电泳没加变性剂
其实提取RNA的条件没那么苛刻,在普通的通风橱里就可以操作,外源RNase的污染比较好消除,关键是破壁时的内源降解。如果用trizol法就必须考虑trizol的量。
另外,相同的方法提取不同细菌的RNA效果也不一样。比如霍乱用trizol法提取效果极差,而沙门菌提取效果就较好;所以霍乱菌最好是用试剂盒过柱子提取,然后浓缩。我提取的是大肠杆菌,摸索了好几种方法,最后确定也是qiagen 的kit提取,然后浓缩。
另外,有一种可以喷的液体,叫做RNase抑制剂,用于消除表面RNase的污染,在客观条件不是很好的时候很有效。
最后祝lz实验顺利,好运啊!
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5楼
2011-04-18 14:25:16
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