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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】序列比对问题
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冰鱼儿

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】序列比对问题 已有4人参与

我做的是菌种鉴定，PCR完了送去公司测序，现在送回来一个基因序列，不知道用BLAST该怎样比对？直接输进去就可以了吗？
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1楼 2011-04-08 22:04:08
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
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dhd997(金币+3): good 2011-04-09 08:43:21
我是用NTI做的对比，对ncbi上的对比不是很熟悉哦，但我记得好像是直接输入就可以的
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2楼2011-04-08 22:10:40
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)
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引用回帖:
Originally posted by 冰鱼儿 at 2011-04-08 22:04:08:
我做的是菌种鉴定，PCR完了送去公司测序，现在送回来一个基因序列，不知道用BLAST该怎样比对？直接输进去就可以了吗？

把两端的引物去掉，NCBI点blast，然后在直接输入序列，运行blastn就是。
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3楼2011-04-09 10:35:39
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yj-lzx

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫生化熊

优秀版主
★
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http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
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曾经的你/以为只要带着那把青春的长剑和赤子的良心就可以说服自己不出卖理想的灵魂/在最寂寞和不得不流泪的晚上/即使连自己都在笑自己傻/依然拔出怀中的长剑~~~
4楼2011-04-09 10:43:26
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house

银虫 (正式写手)
★
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进网址，
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
序列贴到框中。
database点other，前两项是人和老鼠。
点blast
等待。
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5楼2011-04-09 11:04:27
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