应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】关于表面建模
181/1返回列表
查看: 4161  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhang668

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于表面建模

关于MS表面建模的两种方法，一个是 由build>Surfaces>cleave Surfaces.
在对话框中输入要建立的晶面（hkl），选择position。build>Crystals>build vaccum slab。优点是可以自由设置真空层厚度，缺点是cleave Surfaces时切出的表面那层原子总是没掉，这样出现两个表面终端层不一样，即原子层没有镜面对称。
第二个是直接建超胞，然后删掉几层原子作为真空层。这种方法建模快，可以保持原子层为几个晶胞。缺点就是真空层厚度（与原子层比例）固定。
    对于第二种来说，测试原子层和真空层厚度时候比较简单，第一种稍微复杂点。
想问下大家常用的是哪种方法？还有测试厚度和K点的时候，一般以总能为收敛标准还是功函数？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-08 21:43:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phys

木虫 (正式写手)
★ ★
zhang668(金币+1):谢谢参与
bingmou(金币+1): 感谢交流！ 2011-04-08 22:57:44
个人认为这两种方法是一样的，不果一个是人为的，一个是机器帮你切，实际上自己切也一样
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-04-08 22:40:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susie8642

铜虫 (小有名气)
★
zhang668(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by phys at 2011-04-08 22:40:35:
个人认为这两种方法是一样的，不果一个是人为的，一个是机器帮你切，实际上自己切也一样

这种建立表面，如果体系较大，怎么进行收敛性测试呢？会不会需要测试超久时间呢？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-09 11:44:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liusanbing

铜虫 (正式写手)
★
zhang668(金币+1):谢谢参与
先用精度低的测试看看
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-04-09 12:20:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susie8642

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by liusanbing at 2011-04-09 12:20:14:
先用精度低的测试看看

非常感谢，不过不是特别明白，什么叫精度低的测试呢？
赞一下 回复此楼
5楼2011-04-09 14:59:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
zhang668(金币+1):谢谢参与
zhang668(金币+1): 多谢交流 2011-04-09 18:08:05
引用回帖:
Originally posted by susie8642 at 2011-04-09 14:59:16:
非常感谢，不过不是特别明白，什么叫精度低的测试呢？

降低encut，降低K点密度，降低傅里叶网格密度
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-04-09 17:03:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susie8642

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-09 17:03:51:
降低encut，降低K点密度，降低傅里叶网格密度

非常感谢您！但是这样的话，是否能达到收敛性测试的目的呢？收敛性测试不就是想得到最优e-cut和k-point值吗？
赞一下 回复此楼
7楼2011-04-09 17:08:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
zhang668(金币+1): 多谢交流 2011-04-09 18:08:14
引用回帖:
Originally posted by susie8642 at 2011-04-09 17:08:51:
非常感谢您！但是这样的话，是否能达到收敛性测试的目的呢？收敛性测试不就是想得到最优e-cut和k-point值吗？

先用低精度优化到一定程度再用优化后的结构作为测试的输入结构
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2011-04-09 17:12:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susie8642

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-09 17:12:31:
先用低精度优化到一定程度再用优化后的结构作为测试的输入结构

非常感谢！这样就可以在进一步测试中节省时间了吧？但是还是需要进行精密收敛测试的，是吗？
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2011-04-09 18:51:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by susie8642 at 2011-04-09 18:51:58:
非常感谢！这样就可以在进一步测试中节省时间了吧？但是还是需要进行精密收敛测试的，是吗？

是的，这样只是使初始结构更加接近最终基态，可以在为高精度的弛豫节省好多步
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2011-04-09 20:04:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susie8642

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-09 20:04:15:
是的，这样只是使初始结构更加接近最终基态，可以在为高精度的弛豫节省好多步

非常感谢呢！那么请问高精度弛豫之前是不是还是需要进行e-cut和k-point的收敛测试呢？这一步是不是需要较长的时间呢？
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2011-04-09 20:12:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:26:37
引用回帖:
Originally posted by susie8642 at 2011-04-09 20:12:27:
非常感谢呢！那么请问高精度弛豫之前是不是还是需要进行e-cut和k-point的收敛测试呢？这一步是不是需要较长的时间呢？

条件允许的话最好是做收敛测试，以后有了经验就可以少做这样的测试了
赞一下(2人) 回复此楼
12楼2011-04-09 20:31:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susie8642

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-09 20:31:39:
条件允许的话最好是做收敛测试，以后有了经验就可以少做这样的测试了

非常感谢您！我现在想建立一个单晶硅的表面，但是需要建立的比较大，60个原子左右，这样子的话，收敛测试就会非常耗时，我想请教一下，这种情况，单个晶胞的收敛性测试可以拿来用吗？
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2011-04-09 21:10:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiao85

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:27:04
引用回帖:
Originally posted by susie8642 at 2011-04-09 21:10:06:
非常感谢您！我现在想建立一个单晶硅的表面，但是需要建立的比较大，60个原子左右，这样子的话，收敛测试就会非常耗时，我想请教一下，这种情况，单个晶胞的收敛性测试可以拿来用吗？

这个好像不可以吧
赞一下(2人) 回复此楼
14楼2011-05-23 09:24:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by susie8642 at 2011-04-09 21:10:06:
非常感谢您！我现在想建立一个单晶硅的表面，但是需要建立的比较大，60个原子左右，这样子的话，收敛测试就会非常耗时，我想请教一下，这种情况，单个晶胞的收敛性测试可以拿来用吗？

计算表面要单独做真空层厚度的收敛测试，一般10Angstrom就可以
截断能量与K点密度(垂直于表面方向一个K点就可以)可以用体相的，不过要求在这个条件下体相能量可以收敛到非常高的标准，具体可以看手册
赞一下(1人) 回复此楼
15楼2011-05-23 18:54:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wife332020

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
495933楼: Originally posted by susie8642 at 2011-04-09 11:44:22
这种建立表面，如果体系较大，怎么进行收敛性测试呢？会不会需要测试超久时间呢？...

你好，请问下我的切面模型是极性表面，最小原子层数的收敛性确定要根据极性表面的原子层间距会随着原子层数的增加而收敛的特点来确定，我想问下具体怎么操作的啊，收敛前后这个原子层间距的数据变化是在哪里看到的？谢谢！castep的输出结果文件中很多数据也没找到有用的数据
赞一下 回复此楼
16楼2012-07-11 21:10:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

913824

新虫 (初入文坛)
同问啊
回复此楼
17楼2012-10-17 15:44:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx123ppp

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
怎么测试原子层，我测试的就没稳定过！
赞一下 回复此楼
18楼2014-04-12 10:24:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhang668 的主题更新
181/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 01:04 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 00:40 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 8/400 2026-08-23 00:28 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 10/500 2026-08-22 23:42 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 3/150 2026-08-22 22:03 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭