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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】两条序列只有1-2个变异位点，能设计特异引物区别出来吗？
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hexf

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】两条序列只有1-2个变异位点，能设计特异引物区别出来吗？

RT

[ Last edited by 1949stone on 2011-4-2 at 10:54 ]
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1楼 2011-04-01 23:00:23
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hexf

木虫 (正式写手)
1949stone: 为什么说没有特异性？你要看扩出的结果 低温当然可以扩出来 2011-04-03 15:50:03
引用回帖:
Originally posted by shaquila at 2011-04-02 08:40:06:
如果要设计引物，要保证一条引物的三端在这个碱基上，引物要短，降低镁离子浓度，试试最高的退火温度

设计了引物回来，将突变的位点在3'的第一个位点，试过用温度梯度PCR检测退火温度，发现从48-60度都能扩增出条带，并且两个样品都能扩增出来。所以没有特异性
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6楼2011-04-02 10:03:23
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★
hexf(金币+1): 同求同求 2011-04-02 09:08:08
1949stone(金币+1): 鼓励 2011-04-02 10:54:54
我试过用PCR鉴定一个单个碱基突变的基因，效果不好，对照和突变体都能扩增出来……
顶一顶
求高人解答，呵呵~
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-04-01 23:39:49
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shaquila

金虫 (正式写手)
★
hexf(金币+1): 酶切位点的方法已用过，所以想用PCR来分 2011-04-02 09:08:56
1949stone(金币+1): 是个办法 2011-04-02 10:55:06
楼主可以试试有没有酶切位点识别這个序列
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3楼2011-04-02 08:37:07
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shaquila

金虫 (正式写手)
★ ★
hexf(金币+3): 2011-04-02 09:07:42
1949stone(金币+2): 最好分开调 2011-04-02 10:55:28
如果要设计引物，要保证一条引物的三端在这个碱基上，引物要短，降低镁离子浓度，试试最高的退火温度
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4楼2011-04-02 08:40:06
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简单回复
yj-lzx11楼
2011-04-02 12:47   回复  
引用回帖:
Originally posted by dhd997 at 2011-04-02 12:26:45: 开始搞专业的了

~~~
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