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ddang100

银虫 (小有名气)


[交流] 【其他】学习bader的交流

今天看到一篇文献,用bader charge analysis 分析原子的电荷,想学一下,就在站内搜了不少帖子也在bader网站上仔细的学习了一下。基本能够操作。下面有些思考,有经验的请给指点:
1.首先确认运用bader是否正确,我是直接在静态计算的目录下运行bader,提取CHGCAR得到的,ACF.dat等文件。是否正确?(没有先设置LAECHG=.TRUE.,得到AECCAR0,AECCAR2,然后运行bader CHGCAR -ref CHGCAR_sum)如果设置LAECHG=.TRUE.是不是在静态计算的时候设置??;这两种方法得到的差别大吗?
2.我们本来也可以从静态计算得到的OUTCAR里面找到每个原子的带电量,在OUTCAR,为什么不用这个带电量呢?我的理解是OUTCAR 中得到的原子电量是在 wigner-seitz radius内的电量,可能不准确?不知道理解的是否正确。另外我从OUTCAR中得到的电量和用bader得到的电量差0.02e,不大?(只比较了一个原子)
3.我用bader得到的电荷转移来分析从OUTCAR 中得到的磁矩合理吗?OUTCAR 中得到的磁矩不是也是wigner-seitz radius内的吗?
请讨论,指教!!

[ Last edited by ddang100 on 2011-3-17 at 22:08 ]
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韩D小希

铁虫 (正式写手)



ddang100(金币+1):谢谢参与
贺仪(金币+1): 谢谢参与讨论 2012-02-22 10:38:32
引用回帖:
1楼: Originally posted by ddang100 at 2011-03-17 20:50:54:
今天看到一篇文献,用bader charge analysis 分析原子的电荷,想学一下,就在站内搜了不少帖子也在bader网站上仔细的学习了一下。基本能够操作。下面有些思考,有经验的请给指点:
1.首先确认运用bader是否正确 ...

您好 我刚刚开始学习bader analysis ,也在网上找了些教程,有个问题是如何设置INCAR中的NG(X,Y,Z) F 呢 我找的原话是“计算电荷布局分析时,需要比较密的FFT 网格,可以通过NG(X,Y,Z) F来调整,增大这些量,知道总的电荷数目正确”
麻烦您帮理解一下 可以么  谢谢
7楼2012-02-21 15:18:26
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ddang100

银虫 (小有名气)


怎么没有人支持一下
我认为设置LAECHG=.TRUE.得到AECCAR0,AECCAR2应该是在静态计算的时候做,因为我们是想得到电荷密度,大家认为呢,我看到前面有帖子说是在非自洽的情况,我认为不合适
2楼2011-03-18 08:52:58
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ddang100

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2011-03-18 08:58:26:
就是静态计算。

继续请教:在http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/bader/中给的NaCl的例子有两种:1.crystal (vasp chgcar) 2.crystal including core charges (vasp chgcar)
分别是什么意思? 我按照bader CHGCAR -ref CHGCAR_sum的到的结果和第二种crystal including core charges (vasp chgcar)
一致。这两种得到的总的电子数也是不同的,第二种得到是32是不是就是最外层价电子数?第一种呢?是不是包括了Na的此外层电子?
4楼2011-03-22 19:29:10
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★ ★
ddang100(金币+1): 2011-03-22 19:49:54
ellsaking(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-03-22 20:10:51
ellsaking(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-03-22 20:10:52
忘记了,呵呵。得到的电子是赝势文件中列出的每个原子的外层电子数之和。
5楼2011-03-22 19:31:14
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