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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】DGGE新手求教！
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olive0926

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】DGGE新手求教！ 已有10人参与

我刚开始接触DGGE 主要是想研究一下土壤微生物种群的变化
请问各位大侠  DGGE除了可以分析出种群的变化以外 跑出条带的亮度和微生物的量有没有什么联系呢
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1楼 2011-03-11 22:23:41
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在雨中

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2): 感谢交流，欢迎常来 2011-03-12 09:39:10
其实准确来说，DGGE条带的亮度跟那个物种的含量关系不是那么明确。有时候同一条带会是不同物种组成的。这是DGGE方法的限制。
你要真想做不同物种组成的研究，可以用特异引物克隆嘛，多挑点克隆子测序就知道组成了
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2楼2011-03-12 08:16:20
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warrrraw

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
3楼2011-04-02 15:35:16
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wolfebst

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
DGGE无法定量
可以与其他的方法联合使用，如real-time等才能定量
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4楼2011-04-02 16:46:43
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moucheng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wolfebst at 2011-04-02 16:46:43:
DGGE无法定量
可以与其他的方法联合使用，如real-time等才能定量

同意
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人活在世界上不容易，凡事多看开些，开开心心，快快乐乐，健康长寿
5楼2011-04-02 22:29:32
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永远不知道
6楼2011-04-03 00:04:36
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renrui208

银虫 (小有名气)
★
rainwander(金币+1): 鼓励交流~~~ 2011-04-09 17:48:01
恩，不过如果实验室有钱的话，做个454是最好的手段了
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7楼2011-04-03 00:40:51
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mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励交流~~~ 2011-04-09 17:48:10
引用回帖:
Originally posted by renrui208 at 2011-04-03 00:40:51:
恩，不过如果实验室有钱的话，做个454是最好的手段了

用454做这个有点杀鸡用牛刀的感觉吧，没必要，克隆文库就可以了。除非你的样品很特殊或者实验目的意义很深刻，就用454
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2011-04-03 13:33:40
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天鸟

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rainwander(金币+2): 鼓励交流~~~ 2011-04-09 17:48:21
有一定的关系，只能说是可能吧
不能说是绝对的
要对某些中进行绝对的定量的话，可以用FISH或者是某个菌的特定基因做该基因的定量表达
这样是更能让人接受的
赞一下(2人) 回复此楼
快乐生活，我快乐
9楼2011-04-08 18:45:16
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小小木虫8580

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励交流~~~ 2011-04-09 17:48:30
如果你DNA模板都定量且稀释到同一浓度的话，条带的亮度还是可以说明一些问题，但是不绝对
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2011-04-08 21:11:36
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