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321wangke321金虫 (正式写手)
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[交流]
【求助/交流】兼并引物 已有4人参与
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| 我设计了兼并引物，是用蛋白序列设计的，现在想知道引物在序列上的位置，因为不知道扩增片段的长度。如果用比对软件，如何使用呢？我用过Blast及其它软件，都得不到结果，请教下哪位前辈可以给我些指导。谢谢！ |
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321wangke321
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7楼2011-03-11 20:27:21
yabxxh
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-03-11 20:49:26
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| 这位同学，你设计兼并引物的目的是什么呢？是想像特异引物那样从基因组中扩增到特定长度的片段吗？既然是简并引物，那就说明你只是知道某类基因的保守氨基酸序列，你要用这段氨基酸的序列，扩增到你需要的基因。那你为什么还要知道基因的长度呢，你去Blast的话，也只能去Blast那段保守的氨基酸序列吧。不知道你想用什么方法来克隆你的基因，你不会想直接用简并引物扩增出来吧。我觉得你用简并引物扩增的序列测序之后还要进行5‘和3’RACE才能得到你的基因，仅供参考，好运 |
2楼2011-03-11 14:50:46
3楼2011-03-11 15:17:32
321wangke321
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4楼2011-03-11 18:36:52
30