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【求助】siesta 安装出错
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siesta 安装出错前面正常编译到一定程度提示 mpif90 -c -g -O2 -I-L/opt/intel/impi/3.2.2.006/include. -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT /home/Zhanghl209/siesta/Src/MPI/mpi.F Error: Can't open included file 'V_S.uses' Error: Can't open included file 'VS.uses' make[1]: *** [mpi.o] Error 1 make[1]: Leaving directory `/home/Zhanghl209/siesta/Obj/MPI' make: *** [libmpi_f90.a] Error 2 我的编译器和mpi全是intel的,网上没有用intelmpi的列子,自己改就出这样的错误了 |
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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我最初参阅的就是zhangguangping虫友的《smeagol-siesta-transiesta并行安装笔记》,但是后来改动颇多。 至于我先前所说的MPI_INCLUDE=.,学姐给了我一个测试脚本,脚本内容和测试结果如下,望各位虫友给我分析一下(我刚开始学习,对于并行计算不了解) 脚本sge-mpirun-siesta-3.0.sh内容 #! bin/bash # #$ -cwd #$ -j y #$ -S /bin/bash #$ -q parallel.q date source /home/ghzheng/.bashrc mpirun -r ssh -f $TMPDIR/machines -n $NSLOTS /home/ghzheng/SIESTA/Obj/siesta 提交任务 qsub -pe mpich 8 sge-mpirun-siesta-3.0.sh 之后,生成3个文件 sge-mpirun-siesta-3.0.sh.o4972 : /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 2: bin/bash: No such file or directory Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012 /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 12: a.fdf: No such file or directory Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012 sge-mpirun-siesta-3.0.sh.po4972: -catch_rsh /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/active_jobs/4972.1/pe_hostfile compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 a.out:空文件。 请问诸位虫友,这并行安装是否成功? |
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