| 查看: 3361 | 回复: 18 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】siesta 安装出错
|
|||
|
siesta 安装出错前面正常编译到一定程度提示 mpif90 -c -g -O2 -I-L/opt/intel/impi/3.2.2.006/include. -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT /home/Zhanghl209/siesta/Src/MPI/mpi.F Error: Can't open included file 'V_S.uses' Error: Can't open included file 'VS.uses' make[1]: *** [mpi.o] Error 1 make[1]: Leaving directory `/home/Zhanghl209/siesta/Obj/MPI' make: *** [libmpi_f90.a] Error 2 我的编译器和mpi全是intel的,网上没有用intelmpi的列子,自己改就出这样的错误了 |
» 猜你喜欢
面上有专家说实验设备不是我们单位的
已经有5人回复
科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题
已经有20人回复
博士去二本高校当辅导员,如何调整心态?
已经有6人回复
江苏省自然基金 什么时候出结果
已经有6人回复
广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才!!!
已经有11人回复
闲聊
已经有3人回复
如何查询2026年获批项目名称?
已经有3人回复
两块石头
已经有10人回复
售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有15人回复
面上没中,邀请各位路过的虫友分析一下分数
已经有13人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
siesta 计算电子占据数的问题
已经有3人回复
用siesta画声子谱的问题
已经有12人回复
原来编译的siesta突然不能用,重新编译没错,运行出错
已经有13人回复
利用siesta做verlet MD时出现问题siesta: WARNING: Atoms
已经有3人回复
还是SIESTA安装的问题
已经有9人回复
【求助】siesta进行ordern计算出错求助
已经有4人回复
【求助】siesta 做NOSE动力学出错,请高手指教
已经有11人回复
【求助】siesta 计算DOS应该注意什么问题
已经有3人回复
【求助】siesta多个/种分子优化的问题
已经有7人回复
【求助】siesta2.0.2 安装有些警告
已经有4人回复
【求助】siesta3.0 安装,错误一箩筐
已经有11人回复
【求助】siesta中transiesta模块的收敛问题
已经有13人回复
【求助】siesta中关于几何结构优化的问题【完结】
已经有17人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
南京大学能源与资源学院景旭东院士团队博士后招聘公告(南京大学苏州校区)
+2/290
北师大珠海校区胡德平课题组保研招生-理论与计算化学方向-2027秋季入学
+1/45
湖南师范大学招2027年入学分析化学博士1名
+1/28
2027级博士研究生——质谱分析
+5/25
上海交通大学膜分离-纳流控课题组诚聘博士后2-3名
+1/22
哈工大马樱招收2027级计算机类博士生
+1/16
上海交大刘苏萌课题组招收集成电路专项硕士生(ALD前驱体方向,头部企业联培)
+1/9
厦大化院海优团队招收无机化学-材料-物理方向2027级【博士】研究生2名
+1/9
自己1篇和学生2篇 ,祈福!
+1/9
哈工大马樱招收2027级计算机类博士生
+1/8
招聘材料计算,分子动力学模拟相关讲师
+1/6
宁波市中医药研究院招聘科研助理!
+1/6
悉尼科技大学(QS 第87)数据科学/AI招收2027年秋季入学全奖及CSC博士生
+1/5
东南大学招收博士研究生
+1/4
东南大学招收博士研究生
+1/4
东南大学招收博士研究生
+1/4
招聘材料计算,分子动力学模拟合作讲师
+1/4
澳门大学、澳理工联合培养博士招生(2027)
+1/2
新加坡国立大学Sibudjing Kawi教授课题组part-time PhD(热催化/等离子体催化方向)
+1/2
天津大学浙江研究院2026年第二批招聘公告:高分子等方向特聘青年研究员/博士后
+1/1
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
|
我最初参阅的就是zhangguangping虫友的《smeagol-siesta-transiesta并行安装笔记》,但是后来改动颇多。 至于我先前所说的MPI_INCLUDE=.,学姐给了我一个测试脚本,脚本内容和测试结果如下,望各位虫友给我分析一下(我刚开始学习,对于并行计算不了解) 脚本sge-mpirun-siesta-3.0.sh内容 #! bin/bash # #$ -cwd #$ -j y #$ -S /bin/bash #$ -q parallel.q date source /home/ghzheng/.bashrc mpirun -r ssh -f $TMPDIR/machines -n $NSLOTS /home/ghzheng/SIESTA/Obj/siesta 提交任务 qsub -pe mpich 8 sge-mpirun-siesta-3.0.sh 之后,生成3个文件 sge-mpirun-siesta-3.0.sh.o4972 : /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 2: bin/bash: No such file or directory Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012 /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 12: a.fdf: No such file or directory Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012 sge-mpirun-siesta-3.0.sh.po4972: -catch_rsh /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/active_jobs/4972.1/pe_hostfile compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 a.out:空文件。 请问诸位虫友,这并行安装是否成功? |
18楼2012-04-16 18:25:02
2楼2011-03-04 16:34:34
3楼2011-03-04 16:47:08
4楼2011-03-06 10:28:37










回复此楼