| 查看: 2587 | 回复: 18 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】siesta 安装出错
|
|||
|
siesta 安装出错前面正常编译到一定程度提示 mpif90 -c -g -O2 -I-L/opt/intel/impi/3.2.2.006/include. -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT /home/Zhanghl209/siesta/Src/MPI/mpi.F Error: Can't open included file 'V_S.uses' Error: Can't open included file 'VS.uses' make[1]: *** [mpi.o] Error 1 make[1]: Leaving directory `/home/Zhanghl209/siesta/Obj/MPI' make: *** [libmpi_f90.a] Error 2 我的编译器和mpi全是intel的，网上没有用intelmpi的列子，自己改就出这样的错误了 |
回复此楼» 猜你喜欢
职称评审没过，求安慰
已经有56人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有5人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- siesta 计算电子占据数的问题
已经有3人回复
- 用siesta画声子谱的问题
已经有12人回复
- 原来编译的siesta突然不能用，重新编译没错，运行出错
已经有13人回复
- 利用siesta做verlet MD时出现问题siesta: WARNING: Atoms
已经有3人回复
- 还是SIESTA安装的问题
已经有9人回复
- 【求助】siesta进行ordern计算出错求助
已经有4人回复
- 【求助】siesta 做NOSE动力学出错，请高手指教
已经有11人回复
- 【求助】siesta 计算DOS应该注意什么问题
已经有3人回复
- 【求助】siesta多个/种分子优化的问题
已经有7人回复
- 【求助】siesta2.0.2 安装有些警告
已经有4人回复
- 【求助】siesta3.0 安装，错误一箩筐
已经有11人回复
- 【求助】siesta中transiesta模块的收敛问题
已经有13人回复
- 【求助】siesta中关于几何结构优化的问题【完结】
已经有17人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
推荐给英语教学者的一本单词书《金鱼单词讲义：从26个拉丁字母到106万个英语单词》
+3/879
-
中国科大化学与材料科学学院/苏州高研院刘东/熊宇杰教授团队诚聘博士后
+5/785
-
祝福---好运连连---连连---
+4/240
-
DIY科研工具交流
+1/210
-
【CSC招生】拉瓦尔大学流体力学博士项目
+3/201
-
湖北大学食品安全研究团队诚招博士后
+1/181
-
湖南师范大学蒋乐勇教授课题组招收2026届“申请-考核”制博士生
+1/175
-
《春节催婚季，90后男生在线“招募”战友，一起过个轻松年》
+1/154
-
好用的黑科技重组蛋白和生长因子
+1/98
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘
+1/80
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘
+1/79
-
清华大学药学院卢磊课题组诚聘新药研发方向科研助理
+1/76
-
博士招生
+1/32
-
中科大环境系张常勇教授课题组招聘副研/博士后（一人一议）
+1/21
-
长春工业大学 机电工程学院 韩玲 招收申请审核制2026年秋季入学博士生
+1/5
-
中科院和北京工商大学招收2026博士/化学或生物背景
+1/4
-
山东大学集成电路学院博士招生1名
+1/4
-
北京师范大学与企业联合招聘博士后、全职、兼职人员
+1/3
-
诚招“先进材料与柔性电子（柔性储能或柔性天线）”方向联培博士生
+1/2
-
江西理工大学稀土磁性功能材料与物理示范研究生导师创新团队
+1/1
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
我最初参阅的就是zhangguangping虫友的《smeagol-siesta-transiesta并行安装笔记》，但是后来改动颇多。 至于我先前所说的MPI_INCLUDE=.，学姐给了我一个测试脚本，脚本内容和测试结果如下，望各位虫友给我分析一下（我刚开始学习，对于并行计算不了解） 脚本sge-mpirun-siesta-3.0.sh内容 #! bin/bash # #$ -cwd #$ -j y #$ -S /bin/bash #$ -q parallel.q date source /home/ghzheng/.bashrc mpirun -r ssh -f $TMPDIR/machines -n $NSLOTS /home/ghzheng/SIESTA/Obj/siesta 提交任务 qsub -pe mpich 8 sge-mpirun-siesta-3.0.sh 之后，生成3个文件 sge-mpirun-siesta-3.0.sh.o4972 ： /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 2: bin/bash: No such file or directory Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012 /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 12: a.fdf: No such file or directory Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012 sge-mpirun-siesta-3.0.sh.po4972： -catch_rsh /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/active_jobs/4972.1/pe_hostfile compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 compute-0-2 a.out：空文件。 请问诸位虫友，这并行安装是否成功？ |
18楼2012-04-16 18:25:02
2楼2011-03-04 16:34:34
3楼2011-03-04 16:47:08
4楼2011-03-06 10:28:37