应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta 安装出错
51/1返回列表
查看: 3278  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】siesta 安装出错

siesta 安装出错前面正常编译到一定程度提示
mpif90 -c -g -O2 -I-L/opt/intel/impi/3.2.2.006/include. -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT   /home/Zhanghl209/siesta/Src/MPI/mpi.F
Error: Can't open included file 'V_S.uses'
Error: Can't open included file 'VS.uses'
make[1]: *** [mpi.o] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/Zhanghl209/siesta/Obj/MPI'
make: *** [libmpi_f90.a] Error 2

我的编译器和mpi全是intel的，网上没有用intelmpi的列子，自己改就出这样的错误了
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-03-04 15:51:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

郑国Great

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我最初参阅的就是zhangguangping虫友的《smeagol-siesta-transiesta并行安装笔记》，但是后来改动颇多。
    至于我先前所说的MPI_INCLUDE=.，学姐给了我一个测试脚本，脚本内容和测试结果如下，望各位虫友给我分析一下（我刚开始学习，对于并行计算不了解）
脚本sge-mpirun-siesta-3.0.sh内容
#!
bin/bash
#
#$ -cwd
#$ -j y
#$ -S /bin/bash
#$ -q parallel.q
date
source /home/ghzheng/.bashrc
mpirun -r ssh -f $TMPDIR/machines  -n  $NSLOTS /home/ghzheng/SIESTA/Obj/siesta date
提交任务
qsub -pe mpich 8 sge-mpirun-siesta-3.0.sh
之后，生成3个文件
sge-mpirun-siesta-3.0.sh.o4972  ：
/opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 2: bin/bash: No such file or directory
Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012
/opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/job_scripts/4972: line 12: a.fdf: No such file or directory
Sat Apr 14 22:21:05 CST 2012

sge-mpirun-siesta-3.0.sh.po4972：
-catch_rsh /opt/gridengine/default/spool/compute-0-2/active_jobs/4972.1/pe_hostfile
compute-0-2
compute-0-2
compute-0-2
compute-0-2
compute-0-2
compute-0-2
compute-0-2
compute-0-2

a.out：空文件。
请问诸位虫友，这并行安装是否成功？
赞一下 回复此楼
18楼2012-04-16 18:25:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

enola

捐助贵宾 (正式写手)
★
贺仪(金币+3): 谢谢 2011-03-04 17:08:31
zzy870720z(金币+1): 谢谢交流 2011-03-04 18:30:51
贺仪(金币+7): 网上的说法有点问题，不知带怎么弄就好了 2011-04-13 22:16:20
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-03-04 15:51:02:
siesta 安装出错前面正常编译到一定程度提示
mpif90 -c -g -O2 -I-L/opt/intel/impi/3.2.2.006/include. -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT   /home/Zhanghl209/siesta/Src/MPI/mpi.F
Error: Can't open  ...

对于siesta2.0我也一直没装成功，不过我不知道你在并行编译前。有没有进入那个MPI文件夹，make mpi啊？
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-03-04 16:34:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by enola at 2011-03-04 16:34:34:
对于siesta2.0我也一直没装成功，不过我不知道你在并行编译前。有没有进入那个MPI文件夹，make mpi啊？

不需要进入MPI文件夹，make mpi吧？我自己已经安装了intelmpi
我安装的是3.0 现在我自己挑了一个arch.make,修改后正在安装，好像比刚才顺利点了，正在进行中……

[ Last edited by 贺仪 on 2011-3-4 at 16:48 ]
赞一下 回复此楼
3楼2011-03-04 16:47:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-03-04 16:47:08:
不需要进入MPI文件夹，make mpi吧？我自己已经安装了intelmpi
我安装的是3.0 现在我自己挑了一个arch.make,修改后正在安装，好像比刚才顺利点了，正在进行中……

[ Last edited by 贺仪 on 2011-3-4 at  ...

搞定了嘛？我也不是很清楚的。顺便问下，你的Intel MPI那里来的啊？
网上免费的，但是有使用期限。还是其他的啊？
赞一下 回复此楼
4楼2011-03-06 10:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 投稿咨询 +3 wwm09 2026-08-17 4/200 2026-08-18 09:52 by xs74101122
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +4 基诺咪客 2026-08-17 5/250 2026-08-18 08:03 by 基诺咪客
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +12 Ldrop2023 2026-08-13 15/750 2026-08-17 15:02 by 小豌豆_发芽
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭