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clearth

至尊木虫 (正式写手)

[交流] 如何做实验

DGGE条带除了切胶重扩，是不是还可以进行香农指数、主成分分析等操作，望做过的朋友告知一二，谢谢！



[ Last edited by clearth on 2012-9-13 at 18:37 ]
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1楼2011-03-03 21:22:48
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biocontrol

金虫 (小有名气)
★
clearth(金币+1):谢谢参与
clearth(金币+1): 2011-03-07 08:40:01
需要有quantity one软件分析，按照条带的位置分类，然后再用spss或者sas做PCA分析
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2楼2011-03-03 21:52:42
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warrrraw

禁虫 (小有名气)
★
clearth(金币+1):谢谢参与
clearth(金币+1): 2011-03-07 08:39:57
本帖内容被屏蔽
3楼2011-03-05 11:05:42
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tsq0126

金虫 (小有名气)

请教请教

★
clearth(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by biocontrol at 2011-03-03 21:52:42:
需要有quantity one软件分析，按照条带的位置分类，然后再用spss或者sas做PCA分析

我现在的DGGE已经跑完，也用MEGA4做完系统进化树，现在老板让我对条带进行PCA分析，现在网上就是简单介绍一下可以用spss来做PCA分析，但是具体的步骤不知道，不是到学长可否指点一下，很急！！！！
是不是在用spss前有一个转换或者处理，不知道怎么把图片的信息转到spss里面进行数据处理，急切等待你的回复，加我QQ（632916398）吧，方便我向你请教！！

[ Last edited by tsq0126 on 2011-4-15 at 10:25 ]
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5楼2011-04-15 10:22:28
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kerrylee_tw

木虫 (著名写手)
★
clearth(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by tsq0126 at 2011-04-15 10:22:28:
我现在的DGGE已经跑完，也用MEGA4做完系统进化树，现在老板让我对条带进行PCA分析，现在网上就是简单介绍一下可以用spss来做PCA分析，但是具体的步骤不知道，不是到学长可否指点一下，很急！！！！
是不是在 ...

问题解决了吗？
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6楼2011-05-05 16:55:42
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tsq0126

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by kerrylee_tw at 2011-05-05 16:55:42:
问题解决了吗？

还没有，没什么头绪，你呢？
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7楼2011-05-06 12:34:44
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barrey

铁虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
做PCA分析  用NTSYS软件可以得到
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8楼2011-12-20 17:10:30
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barrey

铁虫 (正式写手)
等位基因频率用什么软件？ 输入数据是1,0格式？
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9楼2011-12-20 17:12:22
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在雨中

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by clearth at 2011-03-03 21:22:48:
DGGE条带除了切胶重扩，是不是还可以进行香农指数、主成分分析等操作，望做过的朋友告知一二，谢谢！

把你的DGGE图谱发给我，我给你分析。
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10楼2012-03-09 12:10:40
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xuwentao422

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1348035楼: Originally posted by 在雨中 at 2012-03-09 12:10:40
把你的DGGE图谱发给我，我给你分析。...

太赞了,可以也帮忙指教我一下么?新手啊,不知道怎么算香农指数...望您有空可以加我QQ:289083793
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11楼2012-06-06 16:32:45
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kwt1986

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也是DGGE新手，希望留一个联系方式，谢谢
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12楼2012-07-18 11:48:04
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快乐的米粒

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1348035楼: Originally posted by 在雨中 at 2012-03-09 12:10:40
把你的DGGE图谱发给我，我给你分析。...

好人呐！如果有人帮我分析就好了
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13楼2012-09-13 17:28:28
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京城风雪

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
230975楼: Originally posted by warrrraw at 2011-03-05 11:05:42
可以用bandscan转化后进行分析，可以进行仙农指数等的分析，如果是不同环境还可以做多元尺度分析，相关分析和典型相关性分析等等很多，根据自己的需要。

恩，听起来想法不错呢，能具体展开解释下怎么进行多元尺度分析吗？
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14楼2012-12-02 20:54:44
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zjhzdq

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by 在雨中 at 2012-03-09 12:10:40
把你的DGGE图谱发给我，我给你分析。...

你好，我最近在做DGGE图谱的主成分分析，能向你请教一下吗？
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15楼2013-07-04 15:54:41
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zjhzdq

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主你好，你现在会DGGE的主成分分析吗？最近我也在研究，想向你请教下~~
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16楼2013-07-04 15:57:04
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pjiang4楼
2011-03-05 12:41   回复  
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