[交流] 【求助/交流】DNA提取方法（用于PCR-DGGE）

我是环境专业的，课题做到这里导师要我用PCR-DGGE生物技术来做菌群分析。
我的反应器是陶粒反应器，具体的就是在陶粒上负载吸附了能处理特定污染物的菌体,导师让我每个实验阶段都取样去做优势菌群分析。
请问各位大虾我这个情况，要提取菌的DNA要用怎样的方法？还有陶粒上的微生物怎样才能全部洗脱下来做菌群分析？
在生物方面我只知道皮毛，劳请各位生物方面做过这方面研究的同仁们了！

回复此楼

» 猜你喜欢

为什么蛋白质氨基酸测定大家都测17种? 已经有5人回复
《灰分记：我与坩埚的“灰烬”之恋》已经有3人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有228人回复
求助食品检验工（基础知识），中国劳动社会出版社电子版已经有5人回复
胶体几丁质的结晶度？已经有0人回复
诚挚招收全日制博士！！！中国农业科学院麻类研究所谭志坚研究员课题组招收博士已经有2人回复
三甲基羟乙基丙二胺的合成路线已经有5人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

环境样品地下水中细菌总DNA的提取方法已经有23人回复
CTAB 基因提取方法的问题已经有10人回复
DNA的提取简介，包括法医DNA的提取方法！已经有54人回复
大家都用什么方法提取植物DNA 已经有19人回复
在DNA提取过程中遇到了困惑，希望朋友们可以解答一下,提DNA 的高手请进！！！已经有15人回复
【求助/交流】CTAB法提取了dna，帮我看看图片，帮忙提点改进方法已经有20人回复
【求助/交流】求动物组织DNA提取方法已经有8人回复
【求助/交流】跪求小麦叶绿体DNA的提取方法已经有5人回复
【求助/交流】有关DNA提取已经有11人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:
查看全部散金贴

1楼2011-02-24 17:20:57

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

vanewan

金虫 (小有名气)

应助: 4 (幼儿园)
金币: 525.9
帖子: 136
在线: 38.6小时
虫号: 1009571

引用回帖:

Originally posted by 在雨中 at 2011-02-27 21:15:44:
我常用蛋白酶K-CTAB法提取环境样品中的DNA，超声波破碎法实验室的前辈有人尝试过，据说效果也就那样，可能跟样品特性有关。
我觉得如果你超声时间和强度把握好的话，对DNA片度是没有多大影响的。
你可以用超声 ...

你好，再请问DGGE的变性梯度凝胶怎么做啊？在一般的制胶器上面能做吗？

赞一下

回复此楼

12楼2011-03-01 11:07:59

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 21 个回答

glidingwater

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 348.5
帖子: 201
在线: 48.5小时
虫号: 905131

★ ★ ★
翱宇(金币+1): 鼓励新虫 2011-02-24 19:46:13
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-02-24 19:48:07
vanewan(金币+10): 2011-02-26 18:11:40

使用试剂盒提取总DNA,然后进行PCR，就是做个16s rRNA基因高可变片段的扩增，每种菌虽具有相同长度但具有碱基不同组合的片段，然后进行DGGE，得到条带的多样性，就是菌群的多样性了。
条带粗细的变化反应着优势菌群的变化

[ Last edited by glidingwater on 2011-2-24 at 19:09 ]

赞一下(2人)

回复此楼

2楼2011-02-24 18:46:41

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

vanewan

金虫 (小有名气)

应助: 4 (幼儿园)
金币: 525.9
帖子: 136
在线: 38.6小时
虫号: 1009571

引用回帖:

Originally posted by glidingwater at 2011-02-24 18:46:41:
使用试剂盒提取总DNA,然后进行PCR，就是做个16s rRNA基因高可变片段的扩增，每种菌虽具有相同长度但具有碱基不同组合的片段，然后进行DGGE，得到条带的多样性，就是菌群的多样性了。
条带粗细的变化反应着优势菌 ...

谢谢你的回答，再问下做RNA和DNA扩增有什么区别，哪个更好或者更简便？
有必要做GC夹板吗？

赞一下

回复此楼

3楼2011-02-25 10:05:45

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖