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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】问一下有关gromacs的itp文件中的一个问题
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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】问一下有关gromacs的itp文件中的一个问题

问一下，GROMACS的itp文件里面的name后面的nrexcl到底代表的是什么意思？
这个问题困扰我很久了。
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1楼 2010-12-22 13:24:57
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ruthxu

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zyj8119(金币+9):谢谢同行！！！！ 2010-12-22 18:33:56
zh1987hs(金币+2):这个名词好复杂 2010-12-23 10:34:26
nerxcl 代表连续几个成键相互内排除非成键相互作用势
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2楼2010-12-22 17:26:23
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王精英

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
defines the name of your molecule in this *.top and nrexcl = 3 stands
for excluding non-bonded interactions between atoms that are no further than 3 bonds away
手册上的定义
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3楼2019-03-26 11:01:41
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