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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】问一下有关gromacs的itp文件中的一个问题

问一下，GROMACS的itp文件里面的name后面的nrexcl到底代表的是什么意思？
这个问题困扰我很久了。

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1楼 2010-12-22 13:24:57

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ruthxu

金虫 (正式写手)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 1109.2
帖子: 319
在线: 138小时
虫号: 1159022

★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zyj8119(金币+9):谢谢同行！！！！ 2010-12-22 18:33:56
zh1987hs(金币+2):这个名词好复杂 2010-12-23 10:34:26

nerxcl 代表连续几个成键相互内排除非成键相互作用势

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2楼2010-12-22 17:26:23

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王精英

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 172.2
帖子: 73
在线: 16.5小时
虫号: 10574432

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

defines the name of your molecule in this *.top and nrexcl = 3 stands
for excluding non-bonded interactions between atoms that are no further than 3 bonds away
手册上的定义

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3楼2019-03-26 11:01:41

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