24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

sijifengsd

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 273.7
帖子: 94
在线: 12.1小时
虫号: 794988

[交流] 【求助】基于药效团的分子叠合

大家好：

求助个问题，最近在学习用sybyl 做药效团模型。
做法：在pharmacophore Alignment --GASP打开对话框，Run Name处输入名字，在input区域，选择SLN文件作为分子结构的来源，在【。。。】处要输入*.hts，请问这的hts文件时怎么得到的？

另外，我看有人做基于药效团的分子叠合，然后再做CoMFA研究，请问怎样利用药效团的结果进行分子叠合？

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Sybyl 常见问题及使用教程

» 猜你喜欢

多组分精馏求助已经有3人回复
青椒八年已不青，大家都被折磨成啥样了？已经有12人回复
交叉科学部支持青年基金，对三无青椒是个机会吗？已经有6人回复
免疫学博士有名额，速联系已经有4人回复
国家基金申请书模板内插入图片不可调整大小? 已经有6人回复
国家级人才课题组招收2026年入学博士已经有5人回复
Fe3O4@SiO2合成已经有6人回复
青年基金C终止已经有4人回复
26申博求博导推荐-遥感图像处理方向已经有4人回复
西南交通大学国家级人才团队2026年博士研究生招生（考核制）—机械、材料、力学方向已经有3人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

药效团，COMFA 已经有5人回复
【求助】用DS2.5来做基于受体的药效团设计，有问题请求帮助解答！已经有3人回复
【求助】药效团已经有3人回复
【求助】请求大家帮忙看一下审稿人的回复已经有6人回复
【求助】用DS做3D-QSAR药效团已经有7人回复
【求助】DS里药效团验证分析已经有6人回复
【求助】DS药效团警告已经有5人回复
【求助】DS2.5学习中关于药效团构建的问题已经有7人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2010-12-17 22:14:10

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

应助: 50 (小学生)
金币: 3723.7
帖子: 750
在线: 476.5小时
虫号: 918214

★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-12-20 14:56:03

引用回帖:

Originally posted by sijifengsd at 2010-12-20 08:41:44:

您说的用做出来的药效团叠合是什么意思啊？我知道如果有共同骨架，就可以基于骨架叠合，或者有对接结果，也可以读入对接构象叠合，然后再做CoMFA/CoMSIA分析，这方面的也做过一些。但就是您说的基于药效团叠合有 ...

个人看法，如果有不对的地方请大家指正。药效团做的不多，检验药效团是可以用富集率，就是把数个已知有活性的compound比如说10个，和许多，比如说990个随机挑选的化合物（可用用ZINC库）放在一起，用药效团预测。具体的基于药效团的叠合没有做过，但应该是，先将其他化合物导入药效团模型进行预测，软件会自动搜索最佳构象，把这些最佳构象导入一个database中应该就可以。不过基于药效团或对接的CoMFA结果经常不好，需要很多人工调整。。。。