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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】DS药效团警告
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木子米米

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】DS药效团警告 已有4人参与

本人在用DS做药效团时，结果里出现
WARNING: 1.cpd already exists. Check that molecule names are unique.  
WARNING: 2.cpd already exists. Check that molecule names are unique.  
但是还是有药效团，请问是什么原因导致的，对结果有影响吗？

还有就是我选择的训练集分子在进行构象搜索的时候，有8个分子搜索都将近有255个构象（最大构象设置为255），是不是训练集分子柔性太大，得重新选择呢？

谢谢各位大虾赐教！！
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1楼 2010-06-24 22:09:35
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★
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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-25 08:09:05
你看看你的文件里面分子代号是不是有重叠
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2楼2010-06-25 00:21:05
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木子米米

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2010-06-25 00:21:05:
你看看你的文件里面分子代号是不是有重叠

谢谢！
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3楼2010-06-25 08:55:45
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tingjun

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-25 09:36:44
结构柔性太大不好，你可以看看每个分子对应的255个构象是不是取向基本不一致！
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4楼2010-06-25 09:35:27
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arthurii

木虫 (正式写手)
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lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-26 09:16:04
引用回帖:
Originally posted by 木子米米 at 2010-06-25 08:55:45:

谢谢！

一般都是这个原因，在DS里面编辑的sd文件，经过处理后偶然会有字符丢失的现象，然后就重名了，改一改就好了，原sd文件确定没问题，然后再做柔性多构象就没问题的了
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5楼2010-06-25 23:38:55
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chenyulong
6楼2010-06-25 23:48:47
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