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木子米米

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】DS药效团警告 已有4人参与

本人在用DS做药效团时,结果里出现
WARNING: 1.cpd already exists. Check that molecule names are unique.  
WARNING: 2.cpd already exists. Check that molecule names are unique.  
但是还是有药效团,请问是什么原因导致的,对结果有影响吗?

还有就是我选择的训练集分子在进行构象搜索的时候,有8个分子搜索都将近有255个构象(最大构象设置为255),是不是训练集分子柔性太大,得重新选择呢?

谢谢各位大虾赐教!!
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tingjun

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-25 09:36:44
结构柔性太大不好,你可以看看每个分子对应的255个构象是不是取向基本不一致!
4楼2010-06-25 09:35:27
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arthurii

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-25 08:09:05
你看看你的文件里面分子代号是不是有重叠
2楼2010-06-25 00:21:05
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木子米米

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2010-06-25 00:21:05:
你看看你的文件里面分子代号是不是有重叠

谢谢!
3楼2010-06-25 08:55:45
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arthurii

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-26 09:16:04
引用回帖:
Originally posted by 木子米米 at 2010-06-25 08:55:45:

谢谢!

一般都是这个原因,在DS里面编辑的sd文件,经过处理后偶然会有字符丢失的现象,然后就重名了,改一改就好了,原sd文件确定没问题,然后再做柔性多构象就没问题的了
5楼2010-06-25 23:38:55
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