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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】Gromacs运行出错
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gxsulong

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】Gromacs运行出错

本实验室刚配置个小型服务器用来运行Gromacs（软件经销商安装好），今天刚开始运行就出现了问题：
输入pdb2gmx_mpi命令选择96 43al力场后出现下面的错误：
File input/output error: KA.top

For more information and tips for troubleshooting,;please check the Gromacs website at http://www.gromacs.org/DOCUMENTATION/Errors

是什么原因引起的呢。是不是安装gromacs的时候没有安装力场。希望高手给解答，谢谢！
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1楼 2010-12-16 19:19:38
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lily0712

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我出现了差不多的问题，请问楼主怎么解决的，谢谢！
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5楼2018-11-12 21:31:14
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zh1987hs

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
gxsulong(金币+1):谢谢参与 2010-12-16 19:57:08
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-12-17 12:34:21
gxsulong(金币+1): 2011-04-25 18:38:44
引用回帖:
Originally posted by gxsulong at 2010-12-16 19:19:38:
本实验室刚配置个小型服务器用来运行Gromacs（软件经销商安装好），今天刚开始运行就出现了问题：
输入pdb2gmx_mpi命令选择96 43al力场后出现下面的错误：
File input/output error: KA.top

For more infor ...

....2种情况
1.你没有创建这个名为KA.top的文件
2.你没有cd到这个文件存在的文件夹
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2楼2010-12-16 19:44:42
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gxsulong

至尊木虫 (著名写手)
top文件应该是使用pdb2gmx命令后产生的啊
赞一下 回复此楼
3楼2010-12-16 19:56:40
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591551904

木虫 (小有名气)
gxsulong(金币+1): 2011-04-25 14:24:31
gxsulong(金币+2): 2011-04-25 18:38:26
那个貌似  G43a1 是1不是L
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4楼2011-01-03 10:31:29
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