版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
论文辅导
申博辅导
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(3164)
>
导师招生
(276)
>
文献求助
(270)
>
考博
(126)
>
虫友互识
(108)
>
论文投稿
(102)
>
硕博家园
(90)
>
休闲灌水
(57)
>
考研
(54)
>
公派出国
(51)
>
博后之家
(47)
>
基金申请
(47)
>
绿色求助(高悬赏)
(46)
>
教师之家
(40)
>
论文道贺祈福
(38)
>
招聘信息布告栏
(37)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
计算模拟区
»
分子模拟
»
Gromacs/Amber/NAMD
»
【求助】Gromacs运行出错
5
1/1
返回列表
查看: 1189 | 回复: 4
只看楼主
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖
gxsulong
至尊木虫
(著名写手)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 20061.3
帖子: 2355
在线: 259.3小时
虫号: 115084
[交流]
【求助】Gromacs运行出错
本实验室刚配置个小型服务器用来运行Gromacs(软件经销商安装好),今天刚开始运行就出现了问题:
输入pdb2gmx_mpi命令选择96 43al力场后出现下面的错误:
File input/output error: KA.top
For more information and tips for troubleshooting,;please check the Gromacs website at
http://www.gromacs.org/DOCUMENTATION/Errors
是什么原因引起的呢。是不是安装gromacs的时候没有安装力场。希望高手给解答,谢谢!
回复此楼
» 猜你喜欢
青椒八年已不青,大家都被折磨成啥样了?
已经有14人回复
多组分精馏求助
已经有3人回复
交叉科学部支持青年基金,对三无青椒是个机会吗?
已经有6人回复
免疫学博士有名额,速联系
已经有4人回复
国家基金申请书模板内插入图片不可调整大小?
已经有6人回复
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有5人回复
Fe3O4@SiO2合成
已经有6人回复
青年基金C终止
已经有4人回复
26申博求博导推荐-遥感图像处理方向
已经有4人回复
西南交通大学国家级人才团队2026年博士研究生招生(考核制)—机械、材料、力学方向
已经有3人回复
高级回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
gromacs运行出错,求方案,谢谢!!!
已经有6人回复
Gromacs中,mdrun出错
已经有5人回复
在gromacs中运行mdrun命令时出错
已经有10人回复
gromacs 运行pdb2gmx中出错,pdb2gmx: error while loading shared libraries
已经有3人回复
gromacs运行出错
已经有3人回复
在网上求助计算化学问题时的注意事项-Sobereva
已经有6人回复
【求助】这是我安装gromacs过程,但是出错阿,这个怎么办呢?谢谢
已经有11人回复
【求助】gromacs的又一个问题
已经有22人回复
【求助】gromacs出现了一个问题
已经有10人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
查看全部散金贴
限广州,征女友
+
2
/92
丙烯液相
+
1
/82
[求助] 半导体物理PPT课件 东华理工机电学院 彭新村老师
+
1
/71
时隔多年再次回到小木虫,有一番感慨
+
1
/61
征婚
+
1
/60
武汉工程大学绿碳技术与智能材料课题组诚招2026年博士研究生
+
2
/40
以色列理工-生物质塑料等催化转化及流体力学方向---全奖博士研究生和科研助理
+
2
/38
南开大学物理学院张书辉副教授招收凝聚态物理理论方向博士生、硕士生
+
1
/28
中国石油大学(北京)2026年博士招生2名:化学、材料、石油工程:油田化学
+
1
/26
美国University of Tennessee ~$43,000/yr奖学金 cellulose chemistry and MOFs
+
2
/14
美国密苏里大学堪萨斯城分校(UMKC)生物材料诚聘全奖博士
+
1
/11
博士后, 博士招生 美国大纽约地区 NJIT
+
1
/10
辽宁材料实验室框架复合材料课题组招收联合培养研究生(长期有效)
+
2
/8
真菌的原生质体到底怎么提取呀!!!
+
1
/5
华南理工大学宋波教授招聘材料和化学方向博士后(长期有效)
+
1
/3
中山大学柔性电子学院黄维院士团队诚招柔性可穿戴电子方向博士生(2026年9月入学)
+
1
/2
澳科大诚招2026年秋季全奖博士研究生(药剂学/生物材料方向)
+
1
/2
澳大利亚国立大学 (ANU) | 电化学储能材料 | 全奖博士招生
+
1
/2
层流压差式MFM/MFC在SOFC高温工况中的适配应用
+
1
/2
苏州大学医学院纳米生物医学方向招收申请考核制博士生1名
+
1
/1
1楼
2010-12-16 19:19:38
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
gxsulong
至尊木虫
(著名写手)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 20061.3
帖子: 2355
在线: 259.3小时
虫号: 115084
top文件应该是使用pdb2gmx命令后产生的啊
赞
一下
回复此楼
高级回复
3楼
2010-12-16 19:56:40
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
查看全部 5 个回答
zh1987hs
金虫
(著名写手)
模拟EPI: 9
应助: 81
(初中生)
贵宾: 0.156
金币: 462.4
帖子: 1245
在线: 1248.1小时
虫号: 591536
★ ★ ★
gxsulong(金币+1):谢谢参与 2010-12-16 19:57:08
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-12-17 12:34:21
gxsulong(金币+1): 2011-04-25 18:38:44
引用回帖:
Originally posted by
gxsulong
at 2010-12-16 19:19:38:
本实验室刚配置个小型服务器用来运行Gromacs(软件经销商安装好),今天刚开始运行就出现了问题:
输入pdb2gmx_mpi命令选择96 43al力场后出现下面的错误:
File input/output error: KA.top
For more infor ...
....2种情况
1.你没有创建这个名为KA.top的文件
2.你没有cd到这个文件存在的文件夹
赞
一下
(2人)
回复此楼
2楼
2010-12-16 19:44:42
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
591551904
木虫
(小有名气)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 2513.7
帖子: 163
在线: 332.4小时
虫号: 1047247
gxsulong(金币+1): 2011-04-25 14:24:31
gxsulong(金币+2): 2011-04-25 18:38:26
那个貌似 G43a1 是1不是L
赞
一下
回复此楼
4楼
2011-01-03 10:31:29
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
lily0712
新虫
(初入文坛)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 0.5
帖子: 1
在线: 1.5小时
虫号: 12118027
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我出现了差不多的问题,请问楼主怎么解决的,谢谢!
赞
一下
回复此楼
5楼
2018-11-12 21:31:14
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
查看全部 5 个回答
如果回帖内容含有宣传信息,请如实选中。否则帐号将被全论坛禁言
普通表情
龙
兔
虎
猫
高级回复
(可上传附件)
百度网盘
|
360云盘
|
千易网盘
|
华为网盘
在新窗口页面中打开自己喜欢的网盘网站,将文件上传后,然后将下载链接复制到帖子内容中就可以了。
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定