| 查看: 1072 | 回复: 2 | |||
[交流]
【求助】autodock中的dlg文件怎么看氢键 已有2人参与
|
|
我是做学生实验用的这个软件，是生物大分子和活性小分子对接模拟实验，得到一个dlg文件，请问各位大虾怎么从这个文件里看氢键的信息，麻烦给指明一下。 还有就是 USER (1) Final Intermolecular Energy = -8.67 kcal/mol USER vdW + Hbond + desolv Energy = -7.96 kcal/mol USER Electrostatic Energy = -0.71 kcal/mol USER Moving Ligand-Fixed Receptor = -8.67 kcal/mol USER Moving Ligand-Moving Receptor = +0.00 kcal/mol USER (2) Final Total Internal Energy = +0.00 kcal/mol USER Internal Energy Ligand = +0.00 kcal/mol USER Internal Energy Receptor = +0.00 kcal/mol USER (3) Torsional Free Energy = +8.23 kcal/mol USER (4) Unbound System's Energy = +0.00 kcal/mol USER 上面这些就是所有结合能量的信息了吧 http://d.namipan.com/d/dcdeb2d7e ... 575b151def767650200 附上dlg文件，谢谢啦 |
回复此楼» 猜你喜欢
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有74人回复
-
岩土工程学报什么时候才能终审完呐
已经有4人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有9人回复
-
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有26人回复
-
我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人
已经有16人回复
-
有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验）
已经有12人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Autodock的操作流程---win下
已经有565人回复
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- AutoDock产生的结果dlg文件转化成pdb文件
已经有13人回复
- AutoDock参数设置问题
已经有6人回复
- 【求助】Autodock分析请教
已经有17人回复
- 【求助】关于Autodock中Grid中的问题
已经有9人回复
- 【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发
已经有32人回复
caixin5120 
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 46 (小学生)
- 金币: 5.9
- 散金: 100
- 红花: 3
- 帖子: 483
- 在线: 158.3小时
- 虫号: 576460
- 注册: 2008-06-20
- 专业: 药物化学
2楼2010-12-15 13:44:20
|
[quote]Originally posted by caixin5120 at 2010-12-15 13:44:20: Hb R-eqm = 1.900, weighted Hb epsilon = 0.487, Hb type = 4, vdW + Hbond + desolv Energy = -7.96 kcal/mol Hb Hbond [ Last edited by caixin5120 on 2010-12-15 ... [/quot] 你好，我是分析了5个构象，怎么分出每一个的氢键键长，能量呢？ Hb R-eqm = 1.900, weighted Hb epsilon = 0.487, Hb type = 4, 这些都是代表什么？？// [ Last edited by hbbnu on 2010-12-15 at 18:35 ] |
3楼2010-12-15 18:34:37
25