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【求助】autodock中的dlg文件怎么看氢键 已有2人参与
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我是做学生实验用的这个软件，是生物大分子和活性小分子对接模拟实验，得到一个dlg文件，请问各位大虾怎么从这个文件里看氢键的信息，麻烦给指明一下。 还有就是 USER (1) Final Intermolecular Energy = -8.67 kcal/mol USER vdW + Hbond + desolv Energy = -7.96 kcal/mol USER Electrostatic Energy = -0.71 kcal/mol USER Moving Ligand-Fixed Receptor = -8.67 kcal/mol USER Moving Ligand-Moving Receptor = +0.00 kcal/mol USER (2) Final Total Internal Energy = +0.00 kcal/mol USER Internal Energy Ligand = +0.00 kcal/mol USER Internal Energy Receptor = +0.00 kcal/mol USER (3) Torsional Free Energy = +8.23 kcal/mol USER (4) Unbound System's Energy = +0.00 kcal/mol USER 上面这些就是所有结合能量的信息了吧 http://d.namipan.com/d/dcdeb2d7e ... 575b151def767650200 附上dlg文件，谢谢啦 |
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caixin5120 
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- 专业: 药物化学
2楼2010-12-15 13:44:20
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[quote]Originally posted by caixin5120 at 2010-12-15 13:44:20: Hb R-eqm = 1.900, weighted Hb epsilon = 0.487, Hb type = 4, vdW + Hbond + desolv Energy = -7.96 kcal/mol Hb Hbond [ Last edited by caixin5120 on 2010-12-15 ... [/quot] 你好，我是分析了5个构象，怎么分出每一个的氢键键长，能量呢？ Hb R-eqm = 1.900, weighted Hb epsilon = 0.487, Hb type = 4, 这些都是代表什么？？// [ Last edited by hbbnu on 2010-12-15 at 18:35 ] |
3楼2010-12-15 18:34:37