24小时热门版块排行榜    

查看: 1468  |  回复: 8

gujing136

禁虫 (文坛精英)


[交流] 【求助】大侠们,求叶绿素a的详细的键长键角~~

大侠们,请问有研究叶绿素a结构的吗,我现在要开题了,需要叶绿素a的详细的结构,包含键长键角的。
哪位大侠有的话,直接20金币,不够的话,我可以再追加……谢谢……

我有叶绿素a的结构图的……
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gujing136

禁虫 (文坛精英)


我都等到花儿都谢了……自己顶自己的吧……唉……
2楼2010-12-27 20:31:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmzhong

铁杆木虫 (著名写手)


可以自己用Gaussian 03 计算

★ ★
gujing136(金币+3):我就是想用高斯构建,但是初始的键长键角的数据呢? 2010-12-29 18:26:21
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-30 09:54:40
可以用Gaussian 计算得到叶绿素的键长和键角。
3楼2010-12-29 15:44:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

z5476t4508

新虫 (正式写手)


★ ★ ★
gujing136(金币+5):我现在要用ADF计算……我要植物的叶绿素a……谢谢您给的建议…… 2010-12-30 16:44:52
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-12-31 14:09:52
gujing136(金币+4): 大侠,就麻烦你把细菌叶绿素A的结构发一个给我吧,287471115@qq.com 2011-04-26 10:19:12
引用回帖:
Originally posted by gujing136 at 2010-11-28 00:01:02:
大侠们,请问有研究叶绿素a结构的吗,我现在要开题了,需要叶绿素a的详细的结构,包含键长键角的。
哪位大侠有的话,直接20金币,不够的话,我可以再追加……谢谢……

我有叶绿素a的结构图的……

我有细菌叶绿素A的结构和参数,但是不知道你用什么程序,你要的话我可以给你
另外我记得在找细菌叶绿素结构的时候在amber maillist 上见过叶绿素A的参数,是charmm格式的你可以找找...
4楼2010-12-30 11:20:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

z5476t4508

新虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by xmzhong at 2010-12-29 15:44:16:
可以用Gaussian 计算得到叶绿素的键长和键角。

您好,请问如何通过gaussian计算得到分子的键长键角等参数呢? 只需要gaussian就可以吗?
5楼2010-12-30 19:36:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmzhong

铁杆木虫 (著名写手)


是的

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-31 14:10:07
gujing136(金币+2): 行家……呵呵…… 2011-03-23 20:18:39
先用chenmdraw 画出叶绿素的分子结构,然后用Gaussian 模拟计算,可以输出键长、键角等。
6楼2010-12-31 10:30:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)


★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-31 14:10:14
gujing136(金币+2):有道理有道理……呵呵…… 2011-01-01 01:11:28
引用回帖:
Originally posted by xmzhong at 2010-12-31 10:30:51:
先用chenmdraw 画出叶绿素的分子结构,然后用Gaussian 模拟计算,可以输出键长、键角等。

这样搞,只能得到local minima附近的参数。
比如ferrocene,如果建模的时候画了一个D5h群的,
是优化不出来C5v群的结构的。
窃以为这样复杂的分子,必须有XRD等实验数据才好办。
7楼2010-12-31 11:20:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmzhong

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-31 14:10:21
gujing136(金币+2):叶绿素a有单晶么? 2011-01-01 01:12:09
对于Gaussian,分子复杂不要紧,只是计算时间长而已。
分子结构模型,可以在CHEM 3D 中修改,以满足立体结构要求。
如果采用XRD,是否须是单晶做的?
8楼2010-12-31 11:53:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gujing136(金币+2):哦……查文献没有找到哦…… 2011-01-01 01:12:48
ghcacj(金币+7):谢谢 2011-01-04 17:22:30
引用回帖:
Originally posted by xmzhong at 2010-12-31 11:53:27:
对于Gaussian,分子复杂不要紧,只是计算时间长而已。
分子结构模型,可以在CHEM 3D 中修改,以满足立体结构要求。
如果采用XRD,是否须是单晶做的?

请注意,计算时间长也只能是优化到local minimal。
如果手画的分子到真实的global minimal之间有能垒,
优化是优化不到global minimal的。只有用MC或者MD才行。
但是对于应用来说,一般算什么分子都会有结构的。比如
CCDC数据库、合作组里的cif或者pdb文件什么的。
XRD实验我不懂,我目前为止做的系统都是有结构的。
根据我所有经验的老师讲,自己猜的分子结构的话确实需要很
精细的考虑的。

叶绿素的话有很多人做,需要查一番文献才行。
这东西不能手懒,ChemOffice里简单一画通常是不行的。
9楼2010-12-31 15:08:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gujing136 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 4/200 2026-03-16 20:13 by Wangjingyue
[考研] 环境工程调剂 +6 大可digkids 2026-03-16 6/300 2026-03-16 17:16 by barlinike
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +3 大火山小火山 2026-03-16 5/250 2026-03-16 16:54 by barlinike
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 8/400 2026-03-16 09:45 by xujiaoszu
[考研] 344求调剂 +3 knight344 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:42 by 无际的草原
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-15 6/300 2026-03-16 08:00 by wang_dand
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
[考研] 298求调剂 +3 Vv呀! 2026-03-10 3/150 2026-03-10 22:40 by 剑诗杜康
信息提示
请填处理意见