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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】关于用细胞膜DPPC做小分子的穿膜模拟，有同道中人吗？
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wdali

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于用细胞膜DPPC做小分子的穿膜模拟，有同道中人吗？

小弟从网上自己download了DPPC的pdb文件，想做小分子穿透细胞膜的模拟，请问有谁做过类似的工作，有没有一个操作的过程可以借鉴？因为小弟自己做的时候，遇到好多问题。可能是方法不对吧。
不胜感激。
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1楼 2010-11-12 19:46:11
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wdali

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-11-17 23:03:46
引用回帖:
Originally posted by 200472027 at 2010-11-16 17:45:29:

楼主可以看看namd的教程，其中有一个是关于膜的
另外，楼主下的那个DPPC的具体网址是什么？

果然在gromacs官网上很难找到，我自己去找都找了好半天。
http://www.gromacs.org/Downloads ... rGro96_53a6.zip下载
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6楼2010-11-17 20:07:53
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hzw2008

金虫 (初入文坛)
你在哪儿download的pdb文件，能否告知网址？！
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2楼2010-11-14 11:43:50
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wdali

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hzw2008 at 2010-11-14 11:43:50:
你在哪儿download的pdb文件，能否告知网址？！

在 gromacs的官网上面阿。
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3楼2010-11-15 08:19:16
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200472027

禁虫 (著名写手)
★
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-11-16 22:36:33
本帖内容被屏蔽
4楼2010-11-16 17:44:11
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