[交流] 【求助/交流】关于基因序列比对

Originally posted by lu_zl at 2010-11-04 21:00:24:



1。我觉得是你对蛋白质序列相似度的理解上有些偏差，AA相同时算匹配，亲疏水性相同也算。所以你蛋白序列比对时会觉得相似度很低。其实好多时候40%以上就算同源了。你可以观察下NCBI对蛋白质CDD里面的定义方 ...

Originally posted by yixuanwin at 2010-11-04 15:39:26:
那就说明不是。

Originally posted by lu_zl at 2010-11-04 15:43:50:
你的相似度还应该包括疏水性相同的那部分氨基酸吧？这部分也要加进去啊。