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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】审稿人意见,不是很懂,大家帮帮忙!


1.“I suggest that the authors include the clarifications for the basis set superposition error(BSSE) calculations in the manuscript.”  这句怎么理解??

2.分子内的BSSE,怎么做,看了几篇文献,还是不会,望高手们指点。


[ Last edited by heyo_123 on 2010-10-27 at 15:05 ]
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ykwang

金虫 (正式写手)

heyo_123(金币+1):我说的是intramolecular BSSE 如何算,而非intermolecular BSSE。 2010-10-27 15:03:54
3楼为正解。具体说来,计算某一AB体系的BSSE矫正的过程如下:
1. 用合适的基组分别优化并计算A、B和AB体系的能量E(A)、E(B)和E(AB)。
2. 再用计算AB的基组分别计算AB中的片段A和B的单点能量E‘(A)与E’(B)。
3. 计算BSSE修正能:
        BSSE energy =E(A)+E(B)-E‘(A)-E’(B)
   以及经过BSSE修正以后体系的总能量:
        corrected energy=E(AB)+BSSE energy
一般来说BSSE energy>0,故修正后的体系能量比原来稍高一点。
Nothing_Is_Impossible!
10楼2010-10-27 14:45:02
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Joannaouc

木虫 (著名写手)

heyo_123(金币+1):谢了! 2010-10-26 14:27:21
是不是软件里面有相关的选项啊?
2楼2010-10-26 14:26:14
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


heyo_123(金币+5):能给几个例子吗??我看了好多,就是不知道该怎么做! 2010-10-26 14:48:31
分子内BSSE需要把分子在适当位置进行切割成为2个分子片段后再进行常规BSSE校正处理。注意要让涉及到分子内BSSE的区域仍然保持原来的相对位置不动,而通过调整构型让两个片段中的与BSSE不相关的区域尽量远离。切割点需要进行饱和处理(比如加氢)。
3楼2010-10-26 14:42:52
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

heyo_123(金币+5):谢谢!!能给几个例子吗》??? 2010-10-26 14:49:12
楼主去查下Sławomir J. Grabowski这个人的文章,他做了好多分子内氢键的BSSE计算。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2010-10-26 14:45:42
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