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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】在Syble中用COMSIA法计算分子的Acceptor和Donor数值为零是怎么回事？
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serien1987

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】在Syble中用COMSIA法计算分子的Acceptor和Donor数值为零是怎么回事？ 已有7人参与

如题，请问在Syble中用COMSIA法计算分子的Acceptor和Donor数值为零是怎么回事？会有这种情况出现吗？是分子有问题还是什么问题呢？
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1楼 2010-10-25 21:43:32
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windness

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-10-26 11:53:10
分子中没有N, O或是NH, OH?
楼主最好检查一下所绘制结构的原子类型
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2楼2010-10-26 08:52:49
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mike0601

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-01 09:32:36
最好用sybyl的sketch molecule检测一下是否所有的原子都能被识别
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3楼2010-10-26 12:15:59
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serien1987

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by windness at 2010-10-26 08:52:49:
分子中没有N, O或是NH, OH?
楼主最好检查一下所绘制结构的原子类型

分子中有这种结构，分子导入也没有问题，但是仍然出现了Acceptor=0这种结果，不知道是什么问题
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4楼2010-10-31 10:13:16
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icedreamer

新虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-07-01 20:10:00
莫非，电荷出了问题？没有加电荷？！
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5楼2011-07-01 17:12:32
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lixiaolin530

银虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-07-13 14:59:59
应该不是电荷的问题  我以前也遇到过 不过没找到原因 就最后写出来说就只有前3个有数值了
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上联:沉默是金,下联:吃苦是福,横批:忍
6楼2011-07-12 18:32:51
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Sybyl 常见问题及使用教程》
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故地如重游月圆更寂寞
7楼2011-09-05 19:06:40
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yingsa2012

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也有类似的问题，但是只是COMSIA预测过程中Hydrogen Donor的值为0，而Hydrogen Acceptor的值却并不为0，不知是哪参数设置出了问题，愁人……
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博大可以稀释忧愁，深色可以覆盖浅色
8楼2013-05-15 21:24:39
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yingsa2012

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by serien1987 at 2010-10-31 10:13:16
分子中有这种结构，分子导入也没有问题，但是仍然出现了Acceptor=0这种结果，不知道是什么问题...

而我的是Donor=0，这……
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博大可以稀释忧愁，深色可以覆盖浅色
9楼2013-05-15 21:26:10
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gcg624

木虫之王 (文坛精英)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我在处理氯代联苯类化合物的CoMSIA分析时，donor和acceptor的计算结果也是0；是不是和结构有关呢，还是在氢键场计算前，需要什么设置或作什么计算为前提呢？谢谢，期待有经验的给予解释一下。
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10楼2014-01-09 10:34:34
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