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honglix

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】请教:引物设计的酶切位点等是否计算入Tm中?

请教高手,设计引物时5‘端加的酶切位点等是否在计算Tm时需要计入?上下游引物碱基个数不能相差太多,但是加入5’端的连接子酶切位点等在计算上下游碱基个数差别时是否计入?
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-10-22 10:09:51
honglix(金币+5): 2010-10-22 19:44:18
我习惯分两步
前面是只考虑互补的,大概跑8~10个循环,后面的就考虑酶切位点,提高退火温度
3楼2010-10-22 10:07:33
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
silicare(金币+2):意义重大 2011-01-07 08:26:53
向您请教个问题

想向您请教个问题,就是在这里http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2516058
您的回答是:

我习惯分两步
前面是只考虑互补的,大概跑8~10个循环,后面的就考虑酶切位点,提高退火温度

想请问一下:您是否是普通的PCR 94℃预变性后,8~10个循环(前面是只考虑互补的),后面的就考虑酶切位点,提高退火温度(12-15个循环);然后是72℃ 延伸。共四个循环骤?


-----------------------------
版主说了,不私下解决问题



==+

我说的每个完整的循环都包含延伸步骤啊……请好好回顾PCR的原理
11楼2011-01-06 23:59:52
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