| 查看: 988 | 回复: 2 | |||
titanheart铜虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】救助关于DS药效团的几个问题
|
|
1.用DS建立小分子数据库之前，需要对小分子进行处理么？我直接用下载的SDF文件建立的。 2.用训练集构建药效团之前，是否需要预处理？先前问过相似的问题，仍有些疑问： 用同样的训练集分子，用Ligand Minimization分配立场和能量最小化后， 建立药效团的hypo1 与未经处理的训练集构建的药效团相比，几项指标都有提高（totalcost变小 rmsd变小 correl变大。。。 ） 产生这种变化的原因是什么呢？构建药效团前，是否可以给配体分配立场和能量最小化 3.测试集的相关系数r是如何计算的？ 参考了下面网址的方法：https://community.accelrys.com/message/1617#1617 但是出现了和楼主相同的问题。。。 4.DS和Catalyst在构建药效团上有什么不同？查了一下，绝大多数的文献用的都是Catalyst，不会因为软件价格原因吧。。。 求助各位~~~~~~高手出马啊~~~  |
回复此楼» 猜你喜欢
国自然面上和省基金B类撒花
已经有13人回复
-
华师大读博
已经有5人回复
-
又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗
已经有5人回复
-
急需审稿人！！！
已经有3人回复
-
申博/考博
已经有8人回复
-
295分求调剂
已经有6人回复
-
一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗
已经有13人回复
-
085600材料与化工调剂
已经有6人回复
-
有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业
已经有7人回复
-
337求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 振东集团招聘药效学研究员
已经有10人回复
- 药效团，COMFA
已经有5人回复
- 紧急求救：给小孩办理J2签证，填写DS160表碰到的几个问题
已经有4人回复
- 【求助/交流】蛋白质纯化的疑难问题
已经有11人回复
- 【求助】关于药效学实验原始记录问题
已经有6人回复
- 【讨论】关于中药药效学研究的给药问题
已经有5人回复
- 【求助】基于药效团的分子叠合
已经有17人回复
- 【讨论】GC测单体转化率的问题
已经有15人回复
- 紧急救助！关于英文校稿的一些问题
已经有7人回复
- 【求助】DS里药效团验证分析
已经有6人回复
- 【求助】DS2.5学习中关于药效团构建的问题
已经有7人回复
- 【求助】关于二氧化锆的问题
已经有22人回复
ts2009
木虫 (著名写手)
无业游民
- 模拟EPI: 1
- 应助: 31 (小学生)
- 金币: 1376.3
- 散金: 2793
- 红花: 10
- 帖子: 2350
- 在线: 1328小时
- 虫号: 811355
- 注册: 2009-07-18
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2010-09-17 13:04:40
tjegg
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 6869.3
- 红花: 16
- 帖子: 2615
- 在线: 448小时
- 虫号: 338983
- 注册: 2007-04-05
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
3楼2010-09-17 18:36:30
5