[资源] 【原创】分子对接，同源模建，分子动力学软件介绍帖

">分子对接，同源模建，分子动力学软件介绍帖
作为一个分子模拟领域的门外汉，主要应用一些成型的软件进行课题相关对象的模拟，在接触分子模拟一年多的时间里，多多少少也接触了一些分子对接，同源模建和分子动力学的软件。在此想开一贴，介绍一下我用这些软件的简要介绍，自己的一些心得，也欢迎更多的虫友能对这些方向的软件进行介绍，补充，争取做成一个系列。
初步列下我接触过的软件，以后将持续更新
同源模建：
SWISS-MODEL
MODELLER
Geno3D
phyre
分子对接：
Autodock-5楼
MVD-7楼
iGEMDOCK-2楼
分子动力学：
DESMOND
NAMD
GROMACS
这些软件都仅仅是接触过的，谈不上精通，因此能提供的只是个简单的介绍，其中比较熟悉的，比如AD, iGEMDOCK,Modeller以及SWISS-MODEL可以详细点介绍，其它的就仅当抛砖引玉，希望能引起大家对这些软件应用的探讨，共同进步。

[ Last edited by zh1987hs on 2010-9-18 at 00:07 ]

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