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andywang6137

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】PCR结果不理想,请教高手。 已有15人参与

这是第一次PCR结果,感觉条带不,体系都是按照TaKara 的50ul体系来的。模板,推荐的2.5ng,一般我都用2.5 ul.(反转录前,总RNA稀释了10倍)


就以PCR产物为模板,进行二次PCR。模板量有2.5变为4ul,引物混合物也加倍了,结果还是不好。(第二张图)



后来查看网上需把PCR产物稀释后做模板,,也咨询了师兄,兼并引物条带弱,加大模板或增加循环。综合起来,我就做了如下处理:

(TaKara 50ul推荐体系,buffer 5;Mg2+,3; dNTP 4,模板 2.5ng;引物混合物(20um)2;taq,0.25,剩下的就是加H2O。)

                             原    液      稀释50倍  稀释100倍        原  液

模板量                     2.5  1       2.5     4     4      4          1    1

引物量 (10um)      4     4        8       8     8       8         8    8



以前最多跑35循环,这次加大到45。退火温度50。



结果见第3张图,效果还不如第2张好。



请教高手,这种问题怎么解决。这样的条带能不能做胶回收,T/A克隆。看网上有人说,条带弱,多跑几块胶,一起胶回收,加大量,做T/A克隆,我这个能不能这样做。谢谢!

[ Last edited by andywang6137 on 2010-9-7 at 21:57 ]
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lirui8247461

新虫 (初入文坛)

★ ★
silicare(金币+2):谢谢新虫分享 2010-09-17 22:09:14
silicare:刚发现,您都注册三年了怎么才发了8帖啊 2010-09-17 22:09:42
你可以试试改改PCR的条件:ddH2O 20.5ul   天根Taq buffer 2.5ul  上游引物和下游引物各0.5ul,天根Taq酶0.2ul  模板0.5ul,这样试试看看怎么样。我一直都是这样做的。效果还是不错的
14楼2010-09-17 20:46:57
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