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saradzj银虫 (小有名气)
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【求助】怎样判断优化后的构型是稳定的、合理的？
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我是采用chem 3D来构建初始结构的，首先是采用的chem draw画出分子结构，然后再复制到chem 3D里面得到立体结构，再采用mopac预优化，最后采用PM3进行优化得到稳定构型的，可是现在遇到一个问题：就是我自己画出来的结构与直接从chem draw里面采用名称得到的结构最终优化好的构型是不一致的，并且能量也存在差异，但是我将两个结构都算了频率，都是没有虚频的。 那我应该如何来选择哪个是最稳定的啊，或者我这种方法本身存在问题，请知道的高手指点一下，不胜感激！ |
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3楼2010-09-06 01:38:34
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4楼2010-09-06 08:42:13