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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 优化后分子构型完全转变，求教如何解决
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LinaInverse

木虫 (小有名气)

[求助] 优化后分子构型完全转变，求教如何解决

基组是dft，ub3lyp
优化前和优化后构型如图，分子本身是层状累加（一层阳离子四丁基铵，一层计算的阴离子这样累加）应该绝无可能是优化后的几何构型
急求指导
http://edu.muchong.com/attachment/a7/07/1024554_1326075853_230.jpg

http://edu.muchong.com/attachment/a2/e5/1024554_1326075864_795.jpg
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秀逗魔导师
1楼 2012-01-09 10:25:07
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009(金币+3): 2012-01-09 14:21:07
你说的结构是指晶体吧？
而你优化的是单分子啊， 单分子我觉得你优化后的构型才对啊 这样的配合物单分子怎么能平面呢？

前一段时间也是有个人直接用单分子和晶体构型对比。。。结果悲催了。。
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
2楼2012-01-09 12:07:52
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LinaInverse

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2012-01-09 12:07:52:
你说的结构是指晶体吧？
而你优化的是单分子啊， 单分子我觉得你优化后的构型才对啊 这样的配合物单分子怎么能平面呢？

前一段时间也是有个人直接用单分子和晶体构型对比。。。结果悲催了。。

是指晶体结构

可是我有类似的东西单分子构型优化出来就是平面的啊

那，如果可以的话，能告诉我怎么优化晶体中构型么？
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秀逗魔导师
3楼2012-01-09 15:34:38
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
3楼: Originally posted by LinaInverse at 2012-01-09 15:34:38:
是指晶体结构

可是我有类似的东西单分子构型优化出来就是平面的啊

那，如果可以的话，能告诉我怎么优化晶体中构型么？

首先你要知道一个事情，分子气态或者液态结构和它形成晶体时的结构一般是不一样的（平面分子除外），多数都会有一定的改变，这可能是由于分子的氢键，π作用等造成的。 所以我认为任何单分子的优化，是不能由晶体结构开始的（当然上一次有人和我说是可以的，都是纯粹个人意见，你可以选择性的考虑）。
你那个类似的结构？ 方便贴出来吗？
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
4楼2012-01-09 16:42:33
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LinaInverse

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiewei at 2012-01-09 16:42:33:
首先你要知道一个事情，分子气态或者液态结构和它形成晶体时的结构一般是不一样的（平面分子除外），多数都会有一定的改变，这可能是由于分子的氢键，π作用等造成的。 所以我认为任何单分子的优化，是不能由晶体 ...

发表过的，方便
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秀逗魔导师
5楼2012-01-09 16:55:11
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
期待高手吧， 前面那个是你优化的构型应该是没有问题的，它不太可能是平面。 至于后面那个可能是位阻，具体不清楚，期待高手吧
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
6楼2012-01-09 18:45:02
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LinaInverse

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiewei at 2012-01-09 18:45:02:
期待高手吧， 前面那个是你优化的构型应该是没有问题的，它不太可能是平面。 至于后面那个可能是位阻，具体不清楚，期待高手吧

呵呵麻烦了。吃饭的时候和师兄讨论师兄认为是多重度问题
Co表面加价态3，自旋多重度我设定的是5
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秀逗魔导师
7楼2012-01-09 22:06:36
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿
“基组是dft，ub3lyp”

大哥，DFT是方法，B3LYP是泛函，不是基组。。。
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理论与计算化学，化学物理，生物物理
8楼2012-01-10 12:18:16
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