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LinaInverse

木虫 (小有名气)

[求助] 优化后分子构型完全转变,求教如何解决

基组是dft,ub3lyp
优化前和优化后构型如图,分子本身是层状累加(一层阳离子四丁基铵,一层计算的阴离子这样累加)应该绝无可能是优化后的几何构型
急求指导
http://edu.muchong.com/attachment/a7/07/1024554_1326075853_230.jpg

http://edu.muchong.com/attachment/a2/e5/1024554_1326075864_795.jpg



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秀逗魔导师
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

“基组是dft,ub3lyp”

大哥,DFT是方法,B3LYP是泛函,不是基组。。。
理论与计算化学,化学物理,生物物理
8楼2012-01-10 12:18:16
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009(金币+3): 2012-01-09 14:21:07
你说的结构是指晶体吧?
而你优化的是单分子啊, 单分子我觉得你优化后的构型才对啊 这样的配合物单分子怎么能平面呢?

前一段时间也是有个人直接用单分子和晶体构型对比。。。结果悲催了。。
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
2楼2012-01-09 12:07:52
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LinaInverse

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2012-01-09 12:07:52:
你说的结构是指晶体吧?
而你优化的是单分子啊, 单分子我觉得你优化后的构型才对啊 这样的配合物单分子怎么能平面呢?

前一段时间也是有个人直接用单分子和晶体构型对比。。。结果悲催了。。

是指晶体结构

可是我有类似的东西单分子构型优化出来就是平面的啊

那,如果可以的话,能告诉我怎么优化晶体中构型么?
秀逗魔导师
3楼2012-01-09 15:34:38
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

引用回帖:
3楼: Originally posted by LinaInverse at 2012-01-09 15:34:38:
是指晶体结构

可是我有类似的东西单分子构型优化出来就是平面的啊

那,如果可以的话,能告诉我怎么优化晶体中构型么?

首先你要知道一个事情,分子气态或者液态结构和它形成晶体时的结构一般是不一样的(平面分子除外),多数都会有一定的改变,这可能是由于分子的氢键,π作用等造成的。 所以我认为任何单分子的优化,是不能由晶体结构开始的(当然上一次有人和我说是可以的,都是纯粹个人意见,你可以选择性的考虑)。
你那个类似的结构? 方便贴出来吗?
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
4楼2012-01-09 16:42:33
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