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枚馨言子

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】超大片段连接问题 已有6人参与

我的是两个一万多bp的载体相连,将这两个载体用EcoRI单酶切,然后连接,转化后抗生素的板上,菌落是长满板的,然后做菌落PCR,一条带都没有(我的目的条带一个是3000多一个是5000多),不知道是没有连进去还是PCR片段太大没有扩出条带来。
    望高手能帮忙解答,不胜感激!!(附:其中还有一个问题就是 EcoRI单酶切是将环状质粒切成一条线性片段,多次酶切后每次跑胶都是酶切后比酶切前跑得快,也就是线性片段比环状质粒跑的快,不知道是酶切的问题,还是属于正常现象)
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srlee

铁杆木虫 (小有名气)

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1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-09-05 12:47:59
看的不是太明白,建议酶切后低电压电泳回收条带,再行连接不知道会不会有所改善呢!
2楼2010-09-05 12:20:46
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lzhwin

木虫 (正式写手)

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amisking(金币+2):鼓励交流! 2010-09-05 19:43:41
单酶切又是大片段大载体肯定能够会有很高的自连率,为什么不用双酶切呢?
建议:双酶切或者加大片段的量并且用蓝白斑筛选
3楼2010-09-05 14:46:00
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wangdianxi8

金虫 (小有名气)

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amisking(金币+2):鼓励交流! 2010-09-05 19:43:51
是不是长的菌落,虽然是抗生素选择,但是是假阳性的,另外,你确定你提到DNA了吗?现在有仪器可以监测的,就是可以知道提取物的浓度和纯度,你可以多问一下做分子的同学,这个是很简单的
4楼2010-09-05 14:52:21
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枚馨言子

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lzhwin at 2010-09-05 14:46:00:
单酶切又是大片段大载体肯定能够会有很高的自连率,为什么不用双酶切呢?
建议:双酶切或者加大片段的量并且用蓝白斑筛选

我是将大的载体用EcoRI单酶切开之后,将另一个载体插入到里面,估计双酶切行不通,连接的时候我试了几种连接体系,还是不行呢
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5楼2010-09-05 15:42:39
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枚馨言子

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by wangdianxi8 at 2010-09-05 14:52:21:
是不是长的菌落,虽然是抗生素选择,但是是假阳性的,另外,你确定你提到DNA了吗?现在有仪器可以监测的,就是可以知道提取物的浓度和纯度,你可以多问一下做分子的同学,这个是很简单的

我是直接将已经提取出来的质粒用同一种酶单酶切之后,又将两个载体连接在一起的,应该这方面不会有问题,我知道大片段连接很难连,不知道谁做过大片段连接的,有好的办法不。我听别人说现在有些公司有一种专门连接大片段的载体和酶,不知道谁用这个方法连过,成功率高不高
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6楼2010-09-05 15:47:57
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lzhwin

木虫 (正式写手)

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scelab(金币+2):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-09-05 23:42:38
对啊,如果你两个载体都用单酶切然后连接,那么会产生三种情况:1、载体1自连 2、载体2自连 3、载体1 载体2相互连接。
第三种情况出现的概率很小
7楼2010-09-05 16:33:27
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evan1987

铜虫 (小有名气)

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scelab(金币+5):鼓励新虫!欢迎多来交流!:tiger06: 2010-09-05 23:42:44
建议你载体单酶切后用SAP去磷酸化,这样载体就不会自连了。还有单酶切插入还有一个方向问题,没什么好的筛选方法,就多挑几个菌落做PCR了。
8楼2010-09-05 21:59:45
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jasco

木虫 (正式写手)

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silicare(金币+1):正解 2010-09-06 12:43:28
10k+10k,还是单酶切产物,这个难度相当大,
9楼2010-09-06 09:40:20
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枚馨言子

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by jasco at 2010-09-06 09:40:20:
10k+10k,还是单酶切产物,这个难度相当大,

是呢,我再试试吧,谢谢大家了
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10楼2010-09-08 11:27:37
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