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sulining

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】荧光定量PCR引物跨内含子的问题 已有9人参与

大家好,我知道做荧光定量要设计跨内含子的引物,跨内含子是什么意思呢?是上游引物或下游引物同时落在两个外显子上吗?还是上下游引物分别都落在两个外显子上呢?引物要靠5‘端设计还是3’端设计呢?谢谢回复!
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yangjie86

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我现在也在做这个,还停留在引物,探针设计阶段,常交流呀!
莫回头看背后的身影。
6楼2010-09-02 16:32:21
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
amisking(金币+2): 2010-08-31 21:53:22
是上游引物或下游引物同时落在两个外显子上吗?



引物要靠5‘端设计还是3’端设计呢?

3,因为5端优先降解
2楼2010-08-31 20:15:25
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njauzx

金虫 (小有名气)

★ ★
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-09-01 07:56:23


引物如图吧
3楼2010-08-31 21:54:37
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-09-01 07:56:28
silicare:本版热烈欢迎海归~ 2010-09-01 08:27:16
是说上游引物或者下游引物中的一条同时落在两个外显子上,不含有内含子序列,因为mRNA不含有内含子,这样设计的引物只能检测出mRNA,而不能检测出基因组,对mRNA的定量就相对准确,想想原理你就明白跨内含子设计是什么意思了
4楼2010-08-31 22:40:13
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