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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】荧光定量PCR引物跨内含子的问题
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sulining

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】荧光定量PCR引物跨内含子的问题 已有9人参与

大家好，我知道做荧光定量要设计跨内含子的引物，跨内含子是什么意思呢？是上游引物或下游引物同时落在两个外显子上吗？还是上下游引物分别都落在两个外显子上呢？引物要靠5‘端设计还是3’端设计呢？谢谢回复！
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1楼 2010-08-31 19:45:45
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yangjie86

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我现在也在做这个，还停留在引物，探针设计阶段，常交流呀！
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莫回头看背后的身影。
6楼2010-09-02 16:32:21
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
amisking(金币+2): 2010-08-31 21:53:22
是上游引物或下游引物同时落在两个外显子上吗？

是

引物要靠5‘端设计还是3’端设计呢？

3，因为5端优先降解
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2楼2010-08-31 20:15:25
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njauzx

金虫 (小有名气)
★ ★
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-09-01 07:56:23


引物如图吧
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3楼2010-08-31 21:54:37
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-09-01 07:56:28
silicare:本版热烈欢迎海归~ 2010-09-01 08:27:16
是说上游引物或者下游引物中的一条同时落在两个外显子上，不含有内含子序列，因为mRNA不含有内含子，这样设计的引物只能检测出mRNA，而不能检测出基因组，对mRNA的定量就相对准确，想想原理你就明白跨内含子设计是什么意思了
赞一下(4人) 回复此楼
4楼2010-08-31 22:40:13
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