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【求助/交流】荧光定量PCR引物跨内含子的问题
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sulining
新虫
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[交流]
【求助/交流】荧光定量PCR引物跨内含子的问题
已有9人参与
大家好,我知道做荧光定量要设计跨内含子的引物,跨内含子是什么意思呢?是上游引物或下游引物同时落在两个外显子上吗?还是上下游引物分别都落在两个外显子上呢?引物要靠5‘端设计还是3’端设计呢?谢谢回复!
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【求助/交流】Real time RT-PCR 引物设计问题(高悬赏请高手帮忙)
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1楼
2010-08-31 19:45:45
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potatobing
铜虫
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9楼
:
Originally posted by
2012continue
at 2013-12-06 16:16:06
如果跨的内含子足够大,比如说大于1000bp,引物只要落在外显子上就行。如果跨的内含子比较小,比如说200bp,这时候就要注意其中一条引物应该横跨两个外显子即差不多一半序列在一个外显子上另一半序列在下一个外显子上 ...
请问为什么要在两个外显子上面呢?
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10楼
2014-08-19 14:35:46
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三磷酸腺苷
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专业: 神经系统肿瘤(含特殊感受
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amisking(金币+2): 2010-08-31 21:53:22
是上游引物或下游引物同时落在两个外显子上吗?
是
引物要靠5‘端设计还是3’端设计呢?
3,因为5端优先降解
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2楼
2010-08-31 20:15:25
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njauzx
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专业: 病原细菌与放线菌生物学
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reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-09-01 07:56:23
引物如图吧
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3楼
2010-08-31 21:54:37
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yujiaping1
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-09-01 07:56:28
silicare:本版热烈欢迎海归~ 2010-09-01 08:27:16
是说上游引物或者下游引物中的一条同时落在两个外显子上,不含有内含子序列,因为mRNA不含有内含子,这样设计的引物只能检测出mRNA,而不能检测出基因组,对mRNA的定量就相对准确,想想原理你就明白跨内含子设计是什么意思了
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4楼
2010-08-31 22:40:13
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