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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】请问3D-QSAR中的最佳组分数
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sijifengsd

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请问3D-QSAR中的最佳组分数已有5人参与

请问：
   请问3D-QSAR中的最佳组分数有什么要求么？一般是几可以？我在做CoMFA时利用交叉验证得到的最佳组分数为1可以用么？我也没看到用1惑着2的，我看到的文献好像也都在5左右。自己也不知道1可以用么，可信么。

请高手指点.
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似水年华
1楼2010-08-16 20:26:32
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一步一步

木虫 (著名写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-18 08:57:33
sijifengsd(金币+4):谢谢啦，有问题再向您请教 2010-08-18 14:42:48
引用回帖:
Originally posted by sijifengsd at 2010-08-17 17:09:53:

您的构象是怎么调整的？我是通过Autodock对接得到的构象，我看了一下有些重叠 的不好。但是对接了几次也没调整到理想的构象。很苦恼

Autodock对接的还长在继续，现在还不清楚怎么样。。。我现在用的构象是基于某一化合物的晶体构象得到的其他化合物，经过分子力学优化得到的构象。
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7楼2010-08-18 08:44:22
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tingjun

木虫 (小有名气)
★
sijifengsd(金币+2): 2010-08-17 08:34:12
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-17 16:12:25
那要看你1做的结果好不好，我觉得只要是结果好就行
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2楼2010-08-16 20:33:02
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piscesee

铁杆木虫 (正式写手)
★
sijifengsd(金币+2): 2010-08-17 08:34:23
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-17 16:12:56
用1说明回归后的模型太简单了，相关程度不高，robust不够好，建议再调整调整...
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3楼2010-08-16 20:53:45
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sijifengsd

银虫 (小有名气)

呵呵

引用回帖:
Originally posted by piscesee at 2010-08-16 20:53:45:
用1说明回归后的模型太简单了，相关程度不高，robust不够好，建议再调整调整...

您说的调整是什么意思？我尝试了对化合物进行分组但是不管怎样对training set和test set划分，最佳组分数都是1.而且q2=0.604也不高算是比较好的了。最奇诡的是静电场的贡献为零，立体场的贡献为1。这在以前我还没遇到呢
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似水年华
4楼2010-08-17 08:50:45
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