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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 3D-QSAR运算时，CoMSIA的立体场色块问题
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vivi1988

铜虫 (小有名气)

[交流] 3D-QSAR运算时，CoMSIA的立体场色块问题 已有3人参与

在做3D-QSAR的CoMSIA时，各项参数指标都很好，但是看立体场的显示图时，色块总是很大，即使进行比例调节也没办法，达到50：50时，直接变换显示颜色，无法解释小分子结构特征，这是为什么呢？小分子是类似物，并且也叠合得很好啊
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天道酬勤
1楼 2011-02-24 13:54:05
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createc

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dongdong3881(金币+1): 多谢交流 2011-03-03 14:16:47
引用回帖:
Originally posted by vivi1988 at 2011-02-24 13:54:05:
在做3D-QSAR的CoMSIA时，各项参数指标都很好，但是看立体场的显示图时，色块总是很大，即使进行比例调节也没办法，达到50：50时，直接变换显示颜色，无法解释小分子结构特征，这是为什么呢？小分子是类似物，并且 ...

各项参数是多少？
但估计你做的还是有问题的。如果好，是可以调小的。很大，说明场很均匀，没有峰值
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2楼2011-02-27 15:33:55
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vivi1988

铜虫 (小有名气)
Q2:0.736,R2:0.984。
CoMFA的立体场和静电场都是可调的。你说的问题可能出现在什么地方呢？
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天道酬勤
3楼2011-02-28 09:09:42
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wnzhao

银虫 (小有名气)
★ ★
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dongdong3881(金币+1): 多谢交流 2011-03-03 14:17:05
我也碰到过同样问题，比如说立体场，观察到一堆绿色，没有一丁点的黄色。我重新启动机器后就可以观察到正常绿色、黄色分布图了。很奇怪，也不知道为什么。
建议你管理员身份重新启动机器。
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4楼2011-02-28 17:19:15
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vivi1988

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wnzhao at 2011-02-28 17:19:15:
我也碰到过同样问题，比如说立体场，观察到一堆绿色，没有一丁点的黄色。我重新启动机器后就可以观察到正常绿色、黄色分布图了。很奇怪，也不知道为什么。
建议你管理员身份重新启动机器。

恩，好的！谢谢啦
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天道酬勤
5楼2011-03-02 08:45:36
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createc

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by createc at 2011-02-27 15:33:55:
各项参数是多少？
但估计你做的还是有问题的。如果好，是可以调小的。很大，说明场很均匀，没有峰值

数值挺好，有多少化合物？公共部位叠合的怎样？
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6楼2011-03-04 19:28:34
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