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vivi1988

铜虫 (小有名气)

[交流] 3D-QSAR运算时,CoMSIA的立体场色块问题 已有3人参与

在做3D-QSAR的CoMSIA时,各项参数指标都很好,但是看立体场的显示图时,色块总是很大,即使进行比例调节也没办法,达到50:50时,直接变换显示颜色,无法解释小分子结构特征,这是为什么呢?小分子是类似物,并且也叠合得很好啊
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天道酬勤
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createc

金虫 (小有名气)

★ ★
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dongdong3881(金币+1): 多谢交流 2011-03-03 14:16:47
引用回帖:
Originally posted by vivi1988 at 2011-02-24 13:54:05:
在做3D-QSAR的CoMSIA时,各项参数指标都很好,但是看立体场的显示图时,色块总是很大,即使进行比例调节也没办法,达到50:50时,直接变换显示颜色,无法解释小分子结构特征,这是为什么呢?小分子是类似物,并且 ...

各项参数是多少?
但估计你做的还是有问题的。如果好,是可以调小的。很大,说明场很均匀,没有峰值
2楼2011-02-27 15:33:55
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vivi1988

铜虫 (小有名气)

Q2:0.736,R2:0.984。
CoMFA的立体场和静电场都是可调的。你说的问题可能出现在什么地方呢?
天道酬勤
3楼2011-02-28 09:09:42
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wnzhao

银虫 (小有名气)

★ ★
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dongdong3881(金币+1): 多谢交流 2011-03-03 14:17:05
我也碰到过同样问题,比如说立体场,观察到一堆绿色,没有一丁点的黄色。我重新启动机器后就可以观察到正常绿色、黄色分布图了。很奇怪,也不知道为什么。
建议你管理员身份重新启动机器。
4楼2011-02-28 17:19:15
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vivi1988

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by wnzhao at 2011-02-28 17:19:15:
我也碰到过同样问题,比如说立体场,观察到一堆绿色,没有一丁点的黄色。我重新启动机器后就可以观察到正常绿色、黄色分布图了。很奇怪,也不知道为什么。
建议你管理员身份重新启动机器。

恩,好的!谢谢啦
天道酬勤
5楼2011-03-02 08:45:36
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createc

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by createc at 2011-02-27 15:33:55:
各项参数是多少?
但估计你做的还是有问题的。如果好,是可以调小的。很大,说明场很均匀,没有峰值

数值挺好,有多少化合物?公共部位叠合的怎样?
6楼2011-03-04 19:28:34
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