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dongfangzz

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】PCR引物设计出后是否需要比对? 已有6人参与

  将要做定量PCR,逆转录试剂盒中自带有primer和oligo引物,不需再设计.逆转录后对cDNA进行PCR时要自己设计引物.那么
  据说PCR引物设计出后应进行比对,以避免同源序列的影响.该怎样比对,有什么软件吗?
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微笑漩涡

新虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
NCBI里面有一个电子PCR,把你的引物输入进去,看看PCR结果是不是你想要的。
3楼2010-08-13 09:51:08
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你想比对的话,可以去NCBI里面直接BLAST啊
2楼2010-08-13 09:39:41
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ronghuan

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 微笑漩涡 at 2010-08-13 09:51:08:
NCBI里面有一个电子PCR,把你的引物输入进去,看看PCR结果是不是你想要的。

那里面有电子PCR吗?请指教。
使用clustalx软件可以进行基因序列比对
5楼2010-08-13 10:35:12
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微笑漩涡

新虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

在这个网址上输入你的引物序列进行BLAST,看看最后结果是不是你的目的基因。
6楼2010-08-13 13:04:36
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