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wjlouc

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】autodock 如何对含金属化合物的分子做对接已有2人参与

本人在用autodock 对含金属化合物的分子做对接时, 生成GPF时报错。请教大家是否要对金属做特殊处理？或者是autodock无法做含金属化合物的分子做对接？

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君子生非异也，善假于物也！

1楼2010-07-26 09:12:42

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冰晶石

木虫 (正式写手)

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★
wjlouc(金币+1): 谢谢参与

引用回帖:

2459678楼: Originally posted by xiaoxiao08 at 2012-06-26 16:37:46
可以做的，首先要对金属设定一个价态，

我也碰到了同样的问题，我的是有机钠盐，然后我好像看见有介绍说是直接改pdb文件中金属离子的价态，但是我好像都不是很清楚改哪一列，改完后没变好呢？？？能再仔细说说么，谢谢哦

8楼2012-07-30 16:19:53

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